廣東已檢出,新冠變異株多國蔓延,需要擔(dān)心嗎?
本文作者:陳焰汐
最近,新冠病毒 KP.2 變異株刷屏了。
在此前的幾個(gè)月中,JN.1 已成為全球主流的新冠變異株,而最近出現(xiàn)的 KP.2 也展現(xiàn)出了較快的傳播速度。
據(jù)國家疾控局,KP.2 在今年 1 月被首次檢測到,此后,它在全球流行毒株中的占比逐漸增加,從 1 月上旬的 0.16% 增長至 5 月上旬的 14% 左右,部分國家 KP.2 占比已達(dá)到 10~30%。
目前,世界衛(wèi)生組織已將 KP.2 列入「需要監(jiān)測的變異株」。
傳播力增強(qiáng),但優(yōu)勢有限
KP.2 又名 JN.1.11.1.2,實(shí)際上是 JN.1 的亞分支。根據(jù) GISAID 序列數(shù)據(jù)[1],KP.2 在新冠病毒刺突蛋白基因中存在三個(gè)突變——R346T、F456L 和 V1104L,其中前兩個(gè)突變最為關(guān)鍵。這些突變可以通過改變刺突蛋白的結(jié)構(gòu),增強(qiáng)病毒的免疫逃避能力,從而增強(qiáng)病毒的傳播力。
不過,這些突變帶來的改變可能有限。日本東京大學(xué)團(tuán)隊(duì)近期在 bioRxiv 上發(fā)表的預(yù)印本研究就表示[2],KP.2 的傳播效率比 JN.1 預(yù)計(jì)高出 20~30%,但其感染性可能僅為 JN.1 的不到 10%。國家疾控局也表示,現(xiàn)有研究認(rèn)為,KP.2 的傳播優(yōu)勢和 JN.1 其他亞分支相比不會有大幅提升。
KP.2 與其他主要新冠病毒變異株的有效繁殖數(shù)比較(圖源:參考資料 2)
根據(jù)美國疾控中心(CDC)的新冠病毒變異株監(jiān)測系統(tǒng)[3],今年 2 月 17 日首次監(jiān)測到有意義的 KP.2 毒株傳播,當(dāng)時(shí) JN.1 在監(jiān)測樣本中的占比達(dá) 78.9%,而 KP.2 的占比只有 0.1%。此后,KP.2 在監(jiān)測樣本中的占比便迅速上漲,4 月 13 日時(shí)已占樣本的 6.4%。
根據(jù) CDC 新冠病毒變異株監(jiān)測系統(tǒng)的即時(shí)預(yù)報(bào)模型,預(yù)計(jì) 4 月 27 日 KP.2 在監(jiān)測樣本中的占比將高達(dá) 15.9%,并會在 5 月 11 日以 28.2% 的樣本占比超過 JN.1,成為全美最為流行的新冠病毒變異株。
CDC 新冠病毒變異株監(jiān)測系統(tǒng)的數(shù)據(jù)(圖源:CDC)
一項(xiàng)基于污水監(jiān)測的模型[4]預(yù)測,KP.2 毒株的新冠病毒感染病例數(shù)量將于近期激增,美國境內(nèi)的感染人數(shù)或?qū)⒂?5 月 26 日超過每天 40 萬,且大部分均為 FLiRT 毒株。(注:KP.2 與同樣攜帶有 R346T、F456L 突變的 KP.1.1 被統(tǒng)稱為 FLiRT 毒株)
4 月 16 日至 5 月 26 日的 FLiRT 毒株流行趨勢預(yù)測圖(圖源:參考資料 4)
美國新冠病毒檢測陽性病例數(shù)據(jù)(圖源:參考資料 4)
而在歐盟,根據(jù)歐洲疾控中心呼吸道病毒監(jiān)控簡報(bào)[5],盡管已有檢測到 KP.2 的報(bào)道,但目前歐盟國家流行的新冠病毒變異株仍以 BA.2.86(包括其衍生毒株 JN.1)和 XBB.1.5 及其衍生毒株為主,其他毒株的占比極少。
張文宏最新研判:實(shí)際臨床風(fēng)險(xiǎn)有限
據(jù)國家疾控局的數(shù)據(jù),我國現(xiàn)階段的主要流行株構(gòu)成比排在前三位的為 JN.1、JN.1.16 和 JN.1.4,3 月 11 日首次從廣東本土病例中監(jiān)測到 KP.2 變異株。
截至 5 月 12 日,在我國本土病例中監(jiān)測到 25 條 KP.2 序列。每周報(bào)告的本土序列中 KP.2 占比在 0.05~0.30% 之間,處于極低水平。
國家疾控局專家研判認(rèn)為,考慮到當(dāng)前 KP.2 亞分支感染病例在我國本土病例中的占比極低,以及此前我國 JN.1 引起的疫情目前已經(jīng)降低到較低水平,KP.2 亞分支短期內(nèi)成為我國優(yōu)勢流行株的可能性低,引發(fā)新一次感染高峰的可能性低。
約翰·霍普金斯大學(xué)感染病學(xué)教授 Andrew Pekosz 在接受采訪時(shí)也表示,KP.2 的傳播嚴(yán)重程度可能有限[6],「新冠病毒變異株流行的模式幾年來一直在重演。但重要的是,流行的規(guī)模一直在下降?!?/p>
5 月 15 日,華山感染發(fā)布張文宏教授最新研判,他表示,新冠病毒處于持續(xù)的變異中,但仍很難突破奧密克戎家族。
根據(jù)國家傳染病醫(yī)學(xué)中心聯(lián)合全國 79 家醫(yī)院的監(jiān)測數(shù)據(jù),2024 年 1 月起出現(xiàn) JN.1,并在 1~3 月檢出均在 70% 以上,出現(xiàn) JN.1.1 及 JN.6 等分型,截至 4 月 30 日,仍以 JN.1 檢出為主。
張文宏表示,當(dāng)前監(jiān)測數(shù)據(jù)提示,我國當(dāng)前流行的新冠病毒仍屬奧密克戎 JN.1 為主,后續(xù)雖然 KP.2 仍然會有出現(xiàn)比例增高的可能性,但從國際數(shù)據(jù)來看,美國 CDC 監(jiān)測提示 KP.2 占比上升,但急診就診、住院人數(shù)以及死亡人數(shù)未見明顯變化,因此可以判斷 KP.2 后續(xù)的實(shí)際臨床風(fēng)險(xiǎn)有限。(策劃:z_popeye|監(jiān)制:gyouza)
參考資料:
[1]https://outbreak.info/compare-lineages?pango=KP.2&pango=JN.1&gene=ORF1a&gene=ORF1b&gene=S&threshold=75&dark=false
[2]Kaku Y, Uriu K, Kosugi Y, et al. Virological characteristics of the SARS-CoV-2 KP.2 variant
bioRxiv 2024.04.24.590786; doi: 10.1101/2024.04.24.590786
[3]https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-summary
[4]https://twitter.com/JPWeiland
[5]https://erviss.org/
[6]https://www.nbcnews.com/health/health-news/covid-variant-kp2-summer-uptick-cdc-rcna150883
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