《自然》子刊:迄今為止最大規(guī)模分析顯示,健康人血液中不存在微生物組
原創(chuàng) 代絲雨 奇點(diǎn)網(wǎng) 收錄于合集 #微生物 5個
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血液微生物組,到底存在嗎?
雖然很長一段時間里,我們都認(rèn)為血液是無菌的,但是近年來的一些研究發(fā)現(xiàn),除了敗血癥等疾病情況外,健康人血液中實(shí)際上也存在多種微生物。
那么這可以說血液中也存在所謂的“血液微生物組”嗎?它會像“腸道微生物”一樣成為健康的新風(fēng)向標(biāo)嗎?
《自然·微生物學(xué)》近期發(fā)表的一篇研究為這個問題畫上了句號??茖W(xué)家們對9770個健康人的血液樣本進(jìn)行測序,發(fā)現(xiàn)血液中的少量微生物主要來自于其他器官的共生菌,絕大部分樣本中根本無菌,而且也無法檢測到不同菌種之間的共生模式和它們與宿主表型之間的聯(lián)系。
換言之,血液中有微生物,但是它們不過是天南海北的過路客,血液不存在自己的“原住民”。
論文題圖
首先,我們需要明確一下什么叫“微生物組”。能稱為“組”,那么這些微生物應(yīng)當(dāng)在特定生態(tài)位中,比如口腔和腸道,在彼此之間以及與環(huán)境產(chǎn)生某些相互作用。而且,其中可能存在核心微生物物種,也就是在不同個體之間均會出現(xiàn)的高頻物種,比如人類皮膚微生物組中的表皮葡萄球菌。
血液中能找到符合這些規(guī)則的微生物嗎?
研究者們對來自6個不同隊(duì)列的9770名健康參與者的血液樣本進(jìn)行了迄今為止最大規(guī)模的血液測序分析。當(dāng)然,這些數(shù)據(jù)中人類的DNA要遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于菌的,所以事先處理也非常重要,排除人類DNA數(shù)據(jù)、排除分類起源不明的序列、排除讀取率低的樣本及種種質(zhì)控手段,此時才得到可用于分析的數(shù)據(jù)。
篩選流程
最終,研究者們共在8892份符合標(biāo)準(zhǔn)的樣品中檢測出117種微生物,包括110種細(xì)菌、5種病毒和2種真菌。
這些微生物中,最為常見的是痤瘡丙酸桿菌(Cutibacterium acnes),但也僅有4.7%的樣本中有它的存在,可見“核心物種”一說可以放棄了。
實(shí)際上,有82%的樣品中沒有檢測到任何微生物,其余18%的樣品,中位數(shù)也只是檢測到一種微生物。雖然部分被判定為無微生物的樣本中微生物的讀數(shù)可高達(dá)210萬reads,但是這些最終都被歸類于污染物。
以上結(jié)果完全可以說明,在健康人的血液中,微生物的存在是極其罕見的。
檢測到物種的流行率都很低
查詢有關(guān)疾病中微生物組成的數(shù)據(jù)庫Disbiome之后,研究者發(fā)現(xiàn),全部117種微生物的約50%其實(shí)是來自人體其他部位的共生菌種,約36%為專性厭氧菌或?qū)P约?xì)胞內(nèi)微生物,它們可能是采血過程引入的。
結(jié)合這些微生物的低流行率,研究者認(rèn)為,這些數(shù)據(jù)足以說明血液中的微生物是外源的、是零星進(jìn)入血液的。
研究者還針對微生物之間的相互作用進(jìn)行了分析,結(jié)果并未發(fā)現(xiàn)在其他微生物組中常見的關(guān)聯(lián)。
最后,研究者分析了117種微生物與采血時記錄下的八種宿主表型,包括性別、種族、年齡、BMI、血液總膽固醇、血液甘油三酯、收縮壓和舒張壓,結(jié)果它們都未能表現(xiàn)出與特定微生物存在之間的關(guān)系。
當(dāng)然,這項(xiàng)研究在健康人中開展,只是說明了健康人血液中不存在常駐的“血液微生物組”,對于癌癥或慢性疾病來說,還是可能存在特殊的血液微生物群落的。
參考資料:
[1]Tan, C.C.S., Ko, K.K.K., Chen, H. et al. No evidence for a common blood microbiome based on a population study of 9,770 healthy humans. Nat Microbiol (2023). https://doi.org/10.1038/s41564-023-01350-w
本文作者丨代絲雨
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