首頁 資訊 GHDDI免費開放三項人工智能在線服務,加速新藥研發(fā),賦能制藥行業(yè)

GHDDI免費開放三項人工智能在線服務,加速新藥研發(fā),賦能制藥行業(yè)

來源:泰然健康網(wǎng) 時間:2024年12月22日 07:34

全球健康藥物研發(fā)中心(GHDDI)于2020年12月21日正式對外開放三個人工智能藥物研發(fā)(AIDD)平臺在線服務,包括:COVID-19 人工智能虛擬篩選平臺、ADMET預測評估平臺和基于靶點結(jié)構(gòu)的人工智能超高速虛擬平臺。這三大平臺將免費開放給世界范圍的高校和制藥行業(yè),為其提供新冠小分子藥物虛擬篩選、ADMET成藥性綜合預測和評估以及基于蛋白質(zhì)靶點結(jié)構(gòu)的虛擬篩選等在線服務,加速和賦能藥物研發(fā)。GHDDI 會不斷更新并逐步開放更多AIDD模塊,整理開放源代碼和Github文檔博客,以最高效的方式向全球同步分享研發(fā)成果和行業(yè)知識經(jīng)驗。

早在1月29日,GHDDI人工智能研發(fā)團隊(GHDDI-AIDD)便緊急上線針對新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)研究的一站式科研數(shù)據(jù)與信息共享平臺 “Targeting COVID-19”。該團隊通過運用人工智能自然語言處理技術(shù)對全球范圍內(nèi)的新冠藥物研究進展進行采集和整理,并將所采集的信息進行挖掘分析,進而結(jié)構(gòu)化拓充這一領域的知識譜系?;谶@種結(jié)構(gòu)化知識譜系,團隊利用神經(jīng)網(wǎng)絡算法整合不同維度和尺度的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)建立預測模型,全面驗證并回答從微觀到系統(tǒng)整體不同層面的問題,進而助力科研人員加速新冠藥物研發(fā)。此次推出這三種新的人工智能藥物研發(fā)平臺在線服務是GHDDI的又一抗疫舉措。

COVID-19人工智能虛擬篩選平臺

該平臺是一種小分子藥物虛擬篩選平臺,目前已上線三個模塊:基于配體的虛擬篩選模型,基于網(wǎng)絡的虛擬篩選模型和高級搜索引擎?;凇癟argeting COVID-19”平臺中的70,000多化合物歷史數(shù)據(jù),COVID-19人工智能虛擬篩選平臺已搭建了針對新冠靶標活性、表型活性、抗病毒選擇性等不同維度的深度學習模型,為全球新冠科研工作者提供了免費的藥物虛擬篩選工具。 

平臺鏈接:http://aidd.ghddi.org/covid19/

1608621896740677.png

▲ 基于多尺度網(wǎng)絡的虛擬篩選模型流程示意圖

ADMET預測評估平臺

藥物的ADMET性質(zhì)(吸收、分布、代謝、清除和毒性),是藥物研發(fā)管線的關(guān)鍵考量維度。GHDDI-AIDD團隊通過匯總不同藥物研發(fā)管線的成藥性經(jīng)驗,針對共同且關(guān)鍵的ADMET性質(zhì)收集了超55萬條高質(zhì)量實驗數(shù)據(jù),構(gòu)建了49個深度學習預測模型,并通過ADMET預測評估平臺免費對外開放。新藥研發(fā)工作者只需上傳化合物結(jié)構(gòu)或列表,即可一鍵式全面預測ADMET性質(zhì),并進行系統(tǒng)預測和綜合成藥性評估。該平臺更多模塊持續(xù)開放中。

平臺鏈接:http://aidd.ghddi.org/admet/1608515497624309.png

▲ ADMET成藥性預測評估模型總匯

基于靶點結(jié)構(gòu)的超高速虛擬平臺

為有效減少基于物理模型的計算機輔助藥物設計中“經(jīng)典力學力場的理論誤差”和“巨大算力消耗”等問題,GHDDI-AIDD自主研發(fā)的蛋白質(zhì)靶點深度學習虛擬篩選模型,利用蛋白靶點3D結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)和近200萬靶點-小分子活性數(shù)據(jù),直接使用圖神經(jīng)網(wǎng)絡構(gòu)造蛋白質(zhì)活性位點和小分子的增廣網(wǎng)絡代替分子對接,在185個靶點的訓練和回溯驗證實驗中得到平均AUC=0.945的結(jié)果,并且在計算效率工程方面有很大突破,為單GPU一天1400萬化合物,相較物理分子對接節(jié)省近千倍算力。

平臺鏈接:http://aidd.ghddi.org/sbvs/1608523545941029.png

▲ 基于靶點結(jié)構(gòu)的超高速虛擬篩選平臺建模方法示意圖

自新冠疫情暴發(fā)以來,GHDDI始終致力于加速新冠藥物研發(fā)。截至2020年12月,“Targeting COVID-19”平臺已經(jīng)迭代了600多個版本,除增加中文版功能之外,還隨著新冠科研動向增加了每日自動更新的自主進化功能和模塊,包括新冠小分子藥物體外實驗數(shù)據(jù)模塊[1]、基于自然語言自動化算法的新冠臨床試驗數(shù)據(jù)匯總和挖掘模塊[2]及文獻推薦模塊[3]。這些模塊為科研人員獲取新冠藥研相關(guān)的小分子藥物抗新冠活性動態(tài)、臨床試驗數(shù)據(jù)以及相關(guān)文獻內(nèi)容提供了便利。

秉承“科技向善(Tech for Social Good)”的原則和“為了全球更多人的健康”的夙愿,GHDDI積極推動醫(yī)藥結(jié)構(gòu)化知識數(shù)據(jù)與人工智能算法在開源社區(qū)中的自主進化,促進人工智能技術(shù)良性發(fā)展并最大程度實現(xiàn)制藥領域的知識開放與社群協(xié)作。未來GHDDI還將開放更多的資源,與創(chuàng)新藥研發(fā)機構(gòu)共同助力全球新藥研發(fā)。

[1]https://ghddi-ailab.github.io/Targeting2019-nCoV/preclinical/

[2]https://ghddi-ailab.github.io/Targeting2019-nCoV/clinical/

[3]https://ghddi-ailab.github.io/Targeting2019-nCoV/research_progress/

使用反饋及交流合作,歡迎洽詢:aidd@ghddi.org

致謝:

清華大學工業(yè)開發(fā)研究院:付小龍

阿里云:孫相征 何萬青 李貝

浙江大學智云實驗室:陳文智 張紫徽 郭曄 徐鋒 張華 鄭強 袁書宏 云霞

前端:王超

相關(guān)知識

全球健康藥物研發(fā)中心免費開放科研數(shù)據(jù)與信息共享平臺
“人工智能+”醫(yī)療新范式 賦能行業(yè)創(chuàng)新發(fā)展
國際觀察:人工智能賦能工業(yè)制造,一切剛剛開始
智能語音識別技術(shù):賦能人工智能應用新篇章
醫(yī)藥研發(fā)管線如何開發(fā)規(guī)劃?創(chuàng)新藥仿制藥研發(fā)流程是什么
AI賦能新藥研發(fā),美迪西榮獲“2024年度生物科技十大創(chuàng)新企業(yè)”金手杖獎
數(shù)智賦能大健康產(chǎn)業(yè)新質(zhì)生產(chǎn)力暨第四屆中醫(yī)藥國際發(fā)展大會召開
健康產(chǎn)業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型先行者,中康控股(02361)長期價值不斷釋放?2024年過半,醫(yī)藥行業(yè)增速放緩已成為不爭的事實。國家統(tǒng)計局最新數(shù)據(jù)顯示,2024年上半年醫(yī)藥制造業(yè)規(guī)模以上企業(yè)工業(yè)增加...
人工智能加速數(shù)字醫(yī)療時代到來
AI賦能,智慧醫(yī)療煥發(fā)新生

網(wǎng)址: GHDDI免費開放三項人工智能在線服務,加速新藥研發(fā),賦能制藥行業(yè) http://www.u1s5d6.cn/newsview718976.html

推薦資訊