06月13日的《熱心腸日報》，我們解讀了 10 篇文獻，關(guān)注：菌群-免疫互作，腸菌酶，單核細胞，IBD，診斷模型，外膜囊泡，肝膽病，疲勞，花生過敏，HIV，乳糜瀉。

Cell子刊：Akk分泌絲蘇氨酸t(yī)RNA合成酶助攻宿主免疫穩(wěn)態(tài)

Cell Host and Microbe——[31.316]

① 腸道相關(guān)細菌Akk菌可分泌蘇氨酸t(yī)RNA合成酶(AmTARS)，并發(fā)揮監(jiān)測和調(diào)節(jié)免疫穩(wěn)態(tài)的作用；② 分泌的AmTARS觸發(fā)M2巨噬細胞極化，并通過其進化獲得的結(jié)構(gòu)域與TLR2特異性結(jié)合，協(xié)調(diào)抗炎IL-10的產(chǎn)生；③ 這種相互作用激活MAPK和PI3K/AKT信號通路，并匯聚到CREB，導致產(chǎn)生IL-10和抑制核心炎癥介質(zhì)NF-κB；④ AmTARS可恢復IL-10陽性巨噬細胞，提高血清中IL-10水平，并減輕結(jié)腸炎小鼠結(jié)腸炎。

【主編評語】

腸道菌群影響與多種代謝和炎癥性疾病相關(guān)的宿主生理學，生物體都會產(chǎn)生氨酰-tRNA合成酶 (ARS)，且目前對ARS非翻譯作用的研究主要集中在真核生物上，而共生菌ARS在調(diào)節(jié)宿主穩(wěn)態(tài)中的作用尚不清楚。近日，發(fā)表在Cell Host and Microbe上的這篇文章，發(fā)現(xiàn)分泌的阿克曼菌粘蛋白絲蘇氨酸t(yī)RNA合成酶具有監(jiān)測和調(diào)節(jié)免疫穩(wěn)態(tài)的功能。（@圓圈兒）

【原文信息】

Secreted Akkermansia muciniphila threonyl-tRNA synthetase functions to monitor and modulate immune homeostasis

2023-06-02, doi: 10.1016/j.chom.2023.05.007

周宏偉等Nature子刊：益生菌分泌的一種酶幫助雌鼠抗結(jié)腸炎

Nature Communications——[17.694]

① 鑒定出一種未表征的分泌蛋白（LPH），為大多數(shù)益生菌菌株（8/10）共有，且在多種結(jié)腸炎模型中可保護雌鼠免受結(jié)腸炎侵害；② 功能研究表明，LPH為雙功能肽聚糖水解酶，具有N-乙酰-β-D-胞壁質(zhì)酶和DL-內(nèi)肽酶活性，可產(chǎn)生胞壁酰二肽（MDP，一種NOD2配體）；③ 通過LPH的不同活性（DL-內(nèi)肽酶和N-乙酰-β-D-胞壁質(zhì)酶）位點突變體與NOD2敲除雌鼠組合，證實LPH通過MDP-NOD2信號傳導發(fā)揮抗結(jié)腸炎作用；④ LPH對雌鼠結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)直腸癌具有保護作用。

【主編評語】

分泌蛋白是微生物群影響宿主的直接分子機制之一，因此構(gòu)成了藥物發(fā)現(xiàn)的一個有前途的領域。近日，南方醫(yī)科大學何肖龍、孫凱、周宏偉及團隊在Nature Communications發(fā)表研究，基于生信指導建立了益生菌分泌組的篩選，鑒定出一種未表征的分泌蛋白，該蛋白由大多數(shù)益生菌菌株共享，多項試驗證明它可以在多個模型中保護雌性小鼠免受結(jié)腸炎，值得關(guān)注。（@九卿臣）

【原文信息】

A probiotic bi-functional peptidoglycan hydrolase sheds NOD2 ligands to regulate gut homeostasis in female mice

2023-06-07, doi: 10.1038/s41467-023-38950-3

腸道微生物信號對單核細胞的調(diào)節(jié)作用（綜述）

Trends in Microbiology——[18.23]

① 單核細胞是感知環(huán)境變化的先天免疫細胞，在血液和組織中有不同的發(fā)育模式和命運；② 腸道微生物信號可調(diào)節(jié)單核細胞穩(wěn)態(tài)，影響其產(chǎn)生、存活及分化為巨噬細胞、樹突狀細胞和非經(jīng)典單核細胞；③ 特定的微生物信號可塑造單核細胞的功能，如吞噬作用、抗原呈遞、細胞因子產(chǎn)生、抗菌能力和運輸，從而產(chǎn)生多效性、局部或全身效應；④ 微生物信號對結(jié)腸炎、癌癥和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病中單核細胞的調(diào)節(jié)，可支持其作為單核細胞生物學調(diào)節(jié)劑的治療潛力。

【主編評語】

單核細胞是感知環(huán)境變化并參與自身免疫、神經(jīng)、心血管、代謝疾病以及癌癥的免疫調(diào)節(jié)的先天免疫細胞。新近研究表明，腸道微生物組通過腸外部位的微生物信號塑造單核細胞的生物學特性。在慢性疾病中，微生物信號和單核細胞之間的交流可以促進或抑制疾病進程，Trends in Microbiology最新綜述文章，歸納討論了在穩(wěn)態(tài)和炎癥期間通過腸道微生物信號對單核細胞穩(wěn)態(tài)和功能的調(diào)節(jié)作用。（@RZN）

【原文信息】

Monocyte regulation by gut microbial signals

2023-06-02, doi: 10.1016/j.tim.2023.05.006

朱立新+劉占舉+朱瑞新等：基于腸菌基因的炎癥性腸病AI診斷模型

Gut Microbes——[9.434]

① 納入8個隊列糞便宏基因組數(shù)據(jù)集（含870名CD患者和548名健康對照），基于多維度（物種、微生物基因和SNV水平）評估CD患者菌群變化；② 兩組間識別到227個物種、1047個基因和21877個SNVs有差異；③ 基于AI構(gòu)建CD診斷模型，物種、基因和SNV模型平均AUC為0.97、0.95和0.77，且基因模型內(nèi)外部驗證平均AUC為0.89和0.91，對CD和其他微生物相關(guān)疾病有特異性；④ 磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)對基因模型貢獻最大，celB和manY具有高預測性，且在獨立隊列得到驗證。

【主編評語】

炎癥性腸病與腸道菌群關(guān)系非常密切，可作為一種有前途的非侵入性診斷工具。近日，同濟大學朱瑞新、中山大學六院朱立新、上海市第十人民醫(yī)院劉占舉、中山大學附屬第六醫(yī)院賀青及團隊在Gut Microbes發(fā)表最新研究，整合了來源于多中心的CD和健康對照共1418例樣本的糞便微生物測序數(shù)據(jù)，全面描繪了CD患者中微生物多維度特征的變化模式，利用AI構(gòu)建了微生物多維度診斷模型，評估了各個維度特征診斷潛能的優(yōu)劣，以鑒定最優(yōu)診斷模型，并驗證其疾病特異性，值得關(guān)注。（@九卿臣）

【原文信息】

Microbial genes outperform species and SNVs as diagnostic markers for Crohn’s disease on multicohort fecal metagenomes empowered by artificial intelligence

2023-06-06, doi: 10.1080/19490976.2023.2221428

陶詩煜+魏泓+劉向東：黏膜粘液乳桿菌的胞外囊泡調(diào)節(jié)巨噬細胞表型并維持腸道穩(wěn)態(tài)

NPJ Biofilms and Microbiomes——[8.462]

① 健康和腹瀉仔豬腸道菌群存在顯著差異，共31個菌種在兩組之間顯著變化，如Limosilactobacillus mucosae（黏膜粘液乳桿菌）和羅伊氏乳桿菌等；② 通過糞菌移植，腹瀉仔豬菌群導致無菌小鼠生長遲緩、腸道炎癥損傷、腸道菌群及代謝紊亂；③ 喂養(yǎng)黏膜粘液乳桿菌而非羅伊氏乳桿菌可改善小鼠腹瀉癥狀；④ 黏膜粘液乳桿菌的外膜囊泡依賴于巨噬細胞，調(diào)節(jié)巨噬細胞表型從而減輕ETEC K88引起的腹瀉癥狀。

【主編評語】

腹瀉病具有高死亡率，尤其是兒童和幼小動物。腸道菌群與腹瀉病密切相關(guān)，值得關(guān)注的是一些特定的細菌菌株已顯示出止瀉作用，然而有益菌株的止瀉機制尚未闡明。華中農(nóng)業(yè)大學陶詩煜、魏泓、劉向東及團隊在NPJ Biofilms and Microbiomes發(fā)表最新研究性文章，該團隊使用新生仔豬作為轉(zhuǎn)化模型，在腹瀉仔豬中觀察到的腸道菌群失衡，主要特征是乳桿菌減少、大腸桿菌增加和脂多糖生物合成通路增加，其中Limosilactobacillus mucosae（黏膜粘液乳桿菌）變化顯著，且其胞外囊泡能通過調(diào)節(jié)巨噬細胞表型緩解腹瀉癥狀。（@RZN）

【原文信息】

Limosilactobacillus mucosae-derived extracellular vesicles modulates macrophage phenotype and orchestrates gut homeostasis in a diarrheal piglet model

2023-06-06, doi: 10.1038/s41522-023-00403-6

Nature子刊：膽汁淤積性肝病患者有結(jié)腸炎或是好事！

Nature Communications——[17.694]

① Mdr2 KO小鼠是一種炎癥性腸病-原發(fā)性硬化性膽管炎（IBD-PSC）模型，急性結(jié)腸炎改善Mdr2 KO小鼠的肝細胞損傷和膽汁淤積；② 慢性結(jié)腸炎模型中，結(jié)腸炎和腸屏障損傷改善急性膽汁淤積性肝損傷并導致肝纖維化減少；③ 這是由于結(jié)腸炎和腸屏障損傷引發(fā)細菌成分移位和肝臟炎癥，通過脂多糖激活肝細胞的NF-κB，抑制膽汁酸代謝，而與結(jié)腸炎誘導的微生物膽汁酸代謝改變無關(guān)；④ PSC患者的腸道炎癥與較長的無肝移植生存期相關(guān)。

【主編評語】

原發(fā)性硬化性膽管炎（PSC）是一種以膽汁樹慢性炎癥和進行性纖維化為特征的慢性膽汁淤積性肝病。大多數(shù)PSC患者患有合并炎癥性腸病（IBD），這被認為會促進疾病的發(fā)展和進展。Nature Communications近期發(fā)表的文章，發(fā)現(xiàn)了結(jié)腸炎觸發(fā)的保護環(huán)路，抑制膽汁酸代謝，改善膽汁淤積性肝病。這提示我們，PSC可考慮多器官治療策略。（@章臺柳）

【原文信息】

Colitis ameliorates cholestatic liver disease via suppression of bile acid synthesis

2023-06-06, doi: 10.1038/s41467-023-38840-8

新診斷炎癥性腸病患者的疲勞評估

Journal of Crohn's and Colitis——[10.02]

① 納入IBSEN III隊列中具有完整疲勞數(shù)據(jù)患者983名（≥18歲），其中68.2%為UC，31.8%為CD，評估總疲勞（TF）和嚴重疲勞（SF）與社會人口學、臨床、內(nèi)窺鏡、實驗室及相關(guān)患者的關(guān)聯(lián)；② 與UC相比，CD的SF患病率更高，且與普通人群相比，兩種診斷SF患病率都更高；③ 抑郁癥狀、疼痛強度和睡眠障礙與兩種診斷的TF增加相關(guān)，且臨床疾病活動和Mayo內(nèi)窺鏡評分增加與UC的TF顯著相關(guān)，但以上變量在CD中不顯著；④ 除Mayo內(nèi)窺鏡評分外，對SF有類似發(fā)現(xiàn)。

【主編評語】

炎癥性腸?。↖BD）患者疲勞癥狀非常普遍，但是病理并不完全清楚。本文基于近1000名新診斷炎癥性腸病患者數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)約2/3的IBD患者出現(xiàn)嚴重疲勞癥狀，且與抑郁、睡眠障礙、疼痛程度增加與潰瘍性結(jié)腸炎（UC）和克羅恩?。–D）都有關(guān)，而臨床和內(nèi)鏡活動只與UC有關(guān)。（@Bingbing）

【原文信息】

Fatigue in patients with newly diagnosed inflammatory bowel disease: Results from a prospective inception cohort, the IBSEN III study

2023-06-05, doi: 10.1093/ecco-jcc/jjad094

NEJM：經(jīng)皮免疫療法可治療兒童的花生過敏

New England Journal of Medicine——[176.079]

① 362名1-3歲的花生過敏兒童按2:1分組，分別接受經(jīng)皮免疫療法（含有花生蛋白的貼片）或安慰劑治療，持續(xù)一年；② 應答標準為：干預后的花生蛋白的誘發(fā)劑量達到1000mg（初始誘發(fā)計量＞10mg）或達到300mg（初始誘發(fā)計量≤10mg）；③ 干預組的應答率為67.0%，顯著高于安慰劑組的33.5%；④ 干預組及安慰劑組的嚴重不良事件發(fā)生率分別為7.8%及3.4%，治療相關(guān)的嚴重不良事件發(fā)生率分別為0.4%及0%。

【主編評語】

New England Journal of Medicine上發(fā)表的一項3期臨床試驗結(jié)果，在362名1-3歲的花生過敏兒童中，經(jīng)皮免疫療法（含有花生蛋白的貼片）相比于安慰劑，可更有效地使患兒脫敏。（@aluba）

【原文信息】

Phase 3 Trial of Epicutaneous Immunotherapy in Toddlers with Peanut Allergy

2023-05-11, doi: 10.1056/NEJMoa2212895

HIV感染下腸道菌群及其代謝物與頸動脈粥樣硬化的關(guān)聯(lián)

Microbiome——[16.837]

① 對患有HIV感染或有感染風險的女性開展一項多中心隊列研究，其中320名女性進行頸動脈成像；② 具核梭桿菌與頸動脈斑塊正相關(guān)，而人羅斯氏菌、Roseburia inulinivorans、Odoribacter splanchnicus、糖解梭菌和Johnsonella ignava菌與斑塊負相關(guān)，該結(jié)果在感染和未感染HIV的女性之間一致；③ 具核梭桿菌與血清蛋白質(zhì)組炎癥標志物正相關(guān)；④ 微生物代謝物丙酸咪唑ImP與血清炎癥標志物和頸動脈粥樣硬化正相關(guān)，或與宿主免疫炎癥激活有關(guān)。

【主編評語】

新近研究揭示在HIV感染者中觀察到腸道菌群的變化。腸道菌群在人類動脈粥樣硬化和心血管疾病中起著重要作用，其可能通過調(diào)節(jié)宿主代謝來部分促進動脈粥樣硬化和心血管疾病。然而在HIV感染的背景下，腸道菌群改變?nèi)绾斡绊懰拗餮装Y和代謝物，以及它們與動脈粥樣硬化的關(guān)系尚未得到充分研究。Microbiome最新研究性文章將腸道菌群與宿主循環(huán)炎癥標志物和代謝物相關(guān)聯(lián)，以探索HIV感染背景下腸道菌群與動脈粥樣硬化之間關(guān)系的潛在機制。（@RZN）

【原文信息】

Gut microbiota, circulating inflammatory markers and metabolites, and carotid artery atherosclerosis in HIV infection

2023-05-27, doi: 10.1186/s40168-023-01566-2

益生菌可促進乳糜瀉患兒的BMI增加

Digestive and Liver Disease——[5.165]

① 96名新診斷為乳糜瀉患兒隨機分為兩組，在攝入無谷蛋白飲食的基礎上，47名患兒補充益生菌制劑（含5種乳桿菌屬及雙歧桿菌屬的菌株），49名患兒補充安慰劑；② 持續(xù)干預12周，隨訪3個月和6個月，記錄生長、實驗室和臨床指標；③ 治療3個月和6個月后，兩組的BMI-Z評分均顯著增加，但益生菌組的BMI-Z評分增加顯著高于并快于安慰劑組；④ 治療后，兩組的臨床和實驗室指標均顯著改善，且無顯著差異。

【主編評語】

Digestive and Liver Disease上發(fā)表的一項隨機安慰劑對照試驗結(jié)果，在96名乳糜瀉患兒中，在無谷蛋白飲食的基礎上，補充包含乳桿菌屬及雙歧桿菌屬的益生菌，可顯著促進BMI的增加。（@aluba）

【原文信息】

Effects of the supplementation with a multispecies probiotic on clinical and laboratory recovery of children with newly diagnosed celiac disease: A randomized, placebo-controlled trial

2023-05-08, doi: 10.1016/j.dld.2023.04.021

感謝本期日報的創(chuàng)作者：Sunflower，accepted，Jack Chen，RZN，章臺柳，aluba

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