Nature Metabolism綜述:T細(xì)胞耗竭的代謝和表觀遺傳學(xué)調(diào)控
免疫治療能增強(qiáng)宿主清除腫瘤細(xì)胞和病毒的能力,并已產(chǎn)生了令人矚目的臨床成果。但在長時間暴露于相關(guān)抗原后,CD8+T細(xì)胞會進(jìn)入一種特異性的分化狀態(tài),即為耗竭型T細(xì)胞,這成為免疫治療在慢性病毒感染和腫瘤發(fā)展中發(fā)揮有效抗病毒或抗腫瘤作用的主要障礙之一。越來越多的相關(guān)研究證實,耗竭型T細(xì)胞形成中經(jīng)歷了代謝不足并伴隨著信號分子通路和表觀遺傳學(xué)的整體改變,這導(dǎo)致了有效免疫反應(yīng)的抑制和免疫檢查點治療的無效。2020年10月瑞士洛桑大學(xué)的研究人員于《Nature Metabolism》雜志發(fā)表了一篇名為“Metabolic and epigenetic regulation of T-cell exhaustion”的綜述,對T細(xì)胞耗竭轉(zhuǎn)化過程的代謝與表觀遺傳學(xué)調(diào)控進(jìn)行了系統(tǒng)性概述。
T細(xì)胞激活后,原始CD8+T細(xì)胞(na?ve CD8+T cell)會分化為效應(yīng)T細(xì)胞或記憶T細(xì)胞,這一過程需要代謝重組產(chǎn)能支持。原始T細(xì)胞主要通過氧化磷酸化產(chǎn)能,但在激活后,則通過PI3K-Akt-mTOR通路的調(diào)控而發(fā)生代謝改變以支持其分化為效應(yīng)性T細(xì)胞,從而轉(zhuǎn)變?yōu)橐蕾囉谟醒跆墙徒夤┠芤灾С制淇焖俚姆只桶l(fā)揮效應(yīng)。與之相對應(yīng)的,抗原清除后持續(xù)存在的記憶性T細(xì)胞代謝特征表現(xiàn)為高水平的氧化磷酸化和自噬。另外,線粒體的動態(tài)也與T細(xì)胞代謝相聯(lián)系,以支持細(xì)胞分化或在應(yīng)激條件下的能量需求和免疫反應(yīng)。在效應(yīng)T細(xì)胞中,T細(xì)胞受體(TCR)信號促進(jìn)線粒體分裂并導(dǎo)致較低的呼吸活動。相比之下,記憶T細(xì)胞含有相對較大的線粒體質(zhì)量,線粒體具有融合的超微結(jié)構(gòu)和相對較高的備用呼吸能力(SRC);這些特性被認(rèn)為是在沒有抗原刺激的情況下支持這些細(xì)胞的生存。但是,在腫瘤或慢性病毒感染情況下,由于受到持續(xù)的抗原刺激,T細(xì)胞出現(xiàn)耗竭型表型。
耗竭型T細(xì)胞的特征包括:抑制性受體表達(dá)升高,TCR受刺激后效應(yīng)降低,增殖能力降低。研究也證實耗竭型T細(xì)胞也表現(xiàn)出明顯特有的表觀遺傳學(xué)特征,這也導(dǎo)致了免疫治療效果欠佳。與效應(yīng)性T細(xì)胞和記憶性T細(xì)胞相反,耗竭型T細(xì)胞表現(xiàn)為代謝不足與線粒體呼吸功能和糖酵解抑制;另外,T細(xì)胞耗竭的進(jìn)程也與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力信號反應(yīng)升高有關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)證實了T細(xì)胞代謝重編程對T細(xì)胞分化和效應(yīng)的重要性,并提示代謝不足可能會加劇耗竭型T細(xì)胞的生成。
在這篇綜述中,作者總結(jié)了腫瘤和病毒感染時相應(yīng)的T細(xì)胞分化及代謝改變,討論了T細(xì)胞耗竭與代謝、表觀遺傳調(diào)控的聯(lián)系。此外,還討論了如何利用代謝調(diào)控來調(diào)控耗竭型T細(xì)胞,從而發(fā)揮更好的抗腫瘤和抗病毒免疫。
耗竭型T細(xì)胞如休息或者垂死的戰(zhàn)士
在慢性疾病中機(jī)體免疫系統(tǒng)持續(xù)暴露于抗原和激活信號后,例如在慢性病毒感染或癌癥發(fā)展期間,CD8+ T細(xì)胞分化為一種終末分化狀態(tài),稱為耗竭型T細(xì)胞。在T細(xì)胞耗竭的發(fā)展過程中,CD8+ T細(xì)胞逐漸失去效應(yīng)細(xì)胞因子的產(chǎn)生和增殖潛能,抑制受體PD-1、Tim-3和Lag-3的表達(dá)逐漸增加。耗竭型T細(xì)胞的生理意義主要是防止在慢性感染中的過度病理學(xué)免疫。
有研究表明,耗竭型T細(xì)胞并非是從終末期的效應(yīng)性T細(xì)胞轉(zhuǎn)變而來,而是從記憶性T細(xì)胞前體而來,這意味著持續(xù)的或被擾亂的T細(xì)胞激活信號可以阻礙記憶性T細(xì)胞分化并促進(jìn)耗竭型T細(xì)胞分化表型。值得注意的是,耗竭型T細(xì)胞是一類具有異質(zhì)性的細(xì)胞群,具有不同分化階段和對應(yīng)的特征。如早期耗竭型T細(xì)胞可以被PD-1抗體等免疫檢查點抑制劑(immune checkpoint blockade, ICB)逆轉(zhuǎn)后而恢復(fù)一定的增殖和免疫效應(yīng)力;而終末期階段的耗竭型T細(xì)胞即使抗原刺激消失也會特征性的持續(xù)表達(dá)抑制性受體,增殖能力和效應(yīng)力也極低,也不能被PD-1抑制劑治療而恢復(fù)其抗腫瘤或抗病毒效能。
研究表明,一類特異性表達(dá)TCF-1(T-cell factor 1)的CD8+T細(xì)胞,表現(xiàn)出干細(xì)胞性質(zhì):包括自我修復(fù),增殖,分化為耗竭型T細(xì)胞,在LCMV clone13感染和腫瘤的小鼠中,通過PD-1抗體治療,這類細(xì)胞的這些能力可以被進(jìn)一步增強(qiáng)。這一特異類型的T細(xì)胞,即是前體耗竭型T細(xì)胞,表達(dá)高水平的CXCR5,SLAMF6和TCF-1。研究證實TCF-1表達(dá)水平對這類細(xì)胞形成和干細(xì)胞表型維持具有重要意義。近期一項研究發(fā)現(xiàn),在慢性病毒感染的早期,TCF-1可拮抗終末期效應(yīng)性T細(xì)胞的形成并促進(jìn)前體耗竭型T細(xì)胞的形成;并且,在抗PD-1治療后,這一前體耗竭型T細(xì)胞是逐漸分化為終末期耗竭型T細(xì)胞的主要亞型。有研究表明,TCF-1協(xié)同一些其他轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控了從前體耗竭型T細(xì)胞到終末期耗竭型T細(xì)胞這一多層級性的分化過程(圖1)。這些觀察結(jié)果表明,T細(xì)胞衰竭的分化程序最終將T細(xì)胞鎖定在一個永久性的功能失調(diào)狀態(tài),從而阻礙了T細(xì)胞的病毒特異性和腫瘤免疫反應(yīng)。然而,但在TCF-1特異性細(xì)胞中,決定其向耗竭型T細(xì)胞分化和維持其干細(xì)胞樣表型的潛在機(jī)制和激活過程大部分仍是未知的。
圖1.耗竭型T細(xì)胞的特征和表觀遺傳學(xué)重組
環(huán)境調(diào)節(jié)使T細(xì)胞分化和耗竭發(fā)生偏斜
1.免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞
除了慢性的TCR刺激,在腫瘤微環(huán)境(TME)中多種免疫抑制因素可以影響T細(xì)胞分化并驅(qū)動T細(xì)胞衰竭,包括細(xì)胞因子環(huán)境、營養(yǎng)剝奪和暴露于免疫抑制分子 (圖2)。Treg細(xì)胞經(jīng)常在TME中異常積聚并表達(dá)免疫抑制分子,包括細(xì)胞因子IL-10、IL-35和TGF-β,進(jìn)而抑制T細(xì)胞的抗腫瘤反應(yīng)。腫瘤浸潤性淋巴細(xì)胞(TILs)中Treg細(xì)胞與CD8+ T細(xì)胞的比值升高通常與許多癌癥類型抗PD-1治療后的預(yù)后不良有關(guān)。此外,最近的研究表明,在B16黑色素瘤腫瘤模型中,腫瘤內(nèi)Treg細(xì)胞通過IL-10和IL-35的合作促進(jìn)TILs中的CD8+T細(xì)胞衰竭。腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)的大量積累也被證明會削弱T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤反應(yīng),并通過IL-10的產(chǎn)生和PD-L1的表達(dá)而促進(jìn)T細(xì)胞衰竭。此外,漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞(dendritic cells, DCs)、未成熟樹突狀細(xì)胞(mature dendritic cells, MDSCs)和骨髓源性抑制細(xì)胞(myelid -derived suppressor cells, MDSCs)在TME中表達(dá)高水平的PD-L1而低水平的共刺激配體,它們的聚集也可能導(dǎo)致T細(xì)胞衰竭。這些免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞還通過產(chǎn)生免疫抑制代謝物和消耗免疫支持營養(yǎng)素來抑制T細(xì)胞的免疫反應(yīng)。
2. 營養(yǎng)剝奪
TME中的葡萄糖缺乏主要是由癌細(xì)胞消耗葡萄糖增加引起的,在小鼠黑素瘤和肉瘤模型中,研究證實葡萄糖缺乏可以抑制TILs的殺瘤活性。此外,由于DCs、MDSCs和TAMs中精氨酸酶和吲哚胺-吡咯2,3-雙加氧酶(IDO)的高表達(dá),氨基酸(如精氨酸和色氨酸)的缺失可能進(jìn)一步損害代謝適應(yīng)性,并改TILs的激活和分化程序。從機(jī)制上講,IDO高活性能從TME中消耗色氨酸,從而損害T細(xì)胞功能,可能是通過激酶GCN2的激活損害mTOR活性引起的。此外,由色氨酸降解產(chǎn)生的犬尿氨酸通過激活芳香羥基受體而對T細(xì)胞免疫具有抑制作用;精氨酸消耗會導(dǎo)致T細(xì)胞增殖、細(xì)胞因子產(chǎn)生和TCR表達(dá)的下降。T細(xì)胞的激活被證明也需要大量的蛋氨酸,蛋氨酸作為細(xì)胞甲基化過程中甲基群的供體,使T細(xì)胞分化所需的表觀遺傳重編程成為可能。此外,最近的一項研究證明了絲氨酸從頭生物合成對T細(xì)胞擴(kuò)增應(yīng)答細(xì)菌感染的重要性。盡管葡萄糖、色氨酸、精氨酸、蛋氨酸和絲氨酸在T細(xì)胞激活和效應(yīng)功能中的重要作用已被證明,但它們在T細(xì)胞耗竭中的作用仍未確定。有趣的是,在慢性LCMV感染過程中,PD-1信號被證明可以阻斷有氧糖酵解,并誘導(dǎo)病毒抗原特異性的CD8+T細(xì)胞代謝損傷表型。此外,來自乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒或艾滋病毒感染患者的病毒抗原特異性耗竭型CD8+ T細(xì)胞表現(xiàn)出代謝適應(yīng)度下降??傊?,這些發(fā)現(xiàn)表明營養(yǎng)剝奪可能導(dǎo)致腫瘤和慢性病毒感染中的T細(xì)胞出現(xiàn)耗竭。
除了營養(yǎng)外,在慢性感染和腫瘤中,缺氧或假性缺氧引起的低氧是另一個抑制T細(xì)胞功能的關(guān)鍵因素。缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)是缺氧反應(yīng)的關(guān)鍵因子,在缺氧和脯氨酸羥化酶失活的情況下被激活。有趣的是,在慢性LCMV感染和黑色素瘤腫瘤中,HIF信號是誘導(dǎo)糖酵解所必需的,這被認(rèn)為是一種效應(yīng)特征。例如,在慢性感染期間激活HIF會導(dǎo)致T細(xì)胞過度激活,而在肺癌和黑色素瘤中從T細(xì)胞中刪除HIF則會損害腫瘤誘導(dǎo)T細(xì)胞的活性,并導(dǎo)致T細(xì)胞激活表型的減少。有趣的是,在腫瘤模型中,如黑色素瘤和結(jié)腸癌,通過操縱腫瘤細(xì)胞的氧化代謝來降低缺氧可以改善T細(xì)胞的功能。有報道稱腫瘤耗氧量升高與T細(xì)胞衰竭和受抑的免疫反應(yīng)有關(guān)。然而也有報道稱,缺氧會增加共抑制受體的表達(dá)并抑制T細(xì)胞效應(yīng)功能。這種差異可能是由缺氧持續(xù)時間、所使用的遺傳小鼠模型和培養(yǎng)條件中的營養(yǎng)物質(zhì)造成的,這些因素在很大程度上影響了T細(xì)胞代謝適應(yīng)的結(jié)果。因此,未來的研究需闡明缺氧反應(yīng)在CD8+ T細(xì)胞耗竭和分化程序中的作用。
3. 有害的代謝物
癌癥細(xì)胞的高有氧糖酵解伴隨著乳酸分泌的增多,導(dǎo)致TME內(nèi)乳酸富集,而細(xì)胞外高乳酸水平已經(jīng)被證明通過未知的機(jī)制阻礙T細(xì)胞的增殖和功能。鑒于乳酸可以通過乳酸脫氫酶B生成丙酮酸和NADH,乳酸轉(zhuǎn)化為丙酮酸引起的丙酮酸生成失衡和NADH/NAD+比值升高可能會阻礙有氧糖酵解,從而破壞T細(xì)胞的增殖和效應(yīng)功能。然而,乳酸誘導(dǎo)的代謝轉(zhuǎn)變是否會導(dǎo)致T細(xì)胞耗竭仍未知。此外,TME是一種富含脂質(zhì)的微環(huán)境,這是由于癌細(xì)胞中旺盛的新生脂肪酸合成活性以及脂肪細(xì)胞和脂肪細(xì)胞樣成纖維細(xì)胞的積累。據(jù)報道,這些腫瘤相關(guān)脂質(zhì)可調(diào)節(jié)各種細(xì)胞類型的免疫抑制特征,包括TAMs、MDSCs和DCs。此外,近期有研究報道,非小細(xì)胞肺癌患者TILs中PD-1highCD8+T細(xì)胞的脂質(zhì)含量高于PD-1lowCD8+T細(xì)胞,提示脂質(zhì)代謝可能導(dǎo)致T細(xì)胞耗竭。支持這種假說的是,在B16黑素瘤模型中T細(xì)胞衰竭被證實是ER(內(nèi)質(zhì)網(wǎng))應(yīng)激反應(yīng)激活導(dǎo)致CD8+T細(xì)胞中膽固醇攝取異常增加所驅(qū)動的。但也有報道稱,CD8+T細(xì)胞的漿膜膽固醇水平升高,使TCR聚集增加,從而促進(jìn)免疫突觸形成。抑制膽固醇酯化增強(qiáng)了T細(xì)胞效應(yīng)功能和抗腫瘤反應(yīng),從而突出了膽固醇在T細(xì)胞免疫中的有利作用。此外,促進(jìn)脂質(zhì)分解代謝可顯著提高CD8+ TILs在小鼠黑色素瘤模型中的效應(yīng)功能和腫瘤的殺傷活性;因此,脂質(zhì)積累和分解代謝可能調(diào)節(jié)不同的T細(xì)胞抗腫瘤反應(yīng)。有趣的是,在壞死細(xì)胞引起的TME中,高水平的細(xì)胞外鉀已被證明會阻礙效應(yīng)功能和CD8+TILs中的PI3K-Akt-mTOR信號。出乎意料的是,腫瘤間質(zhì)液中升高的鉀水平可能會促進(jìn)TILs獲得干細(xì)胞特性,進(jìn)而通過促進(jìn)自噬、獨特的代謝程序和調(diào)控衰竭和效應(yīng)功能的基因組位點組蛋白乙?;慕档蛠肀Wo(hù)CD8+TILs的抗腫瘤能力。除了鉀,在B16F10黑色素瘤模型中,金屬硫蛋白(調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)鋅代謝和某些鋅指轉(zhuǎn)錄因子,如GATA-3和IKZF2)的表達(dá)被發(fā)現(xiàn)在單核細(xì)胞洗脫時功能失調(diào)的CD8+ TILs中上調(diào)。此外,基因靶向GATA-3可能通過增加細(xì)胞因子的產(chǎn)生來提高抗腫瘤活性,這表明鋅在T細(xì)胞中的代謝可能也協(xié)調(diào)了分化程序和消耗程序。這些發(fā)現(xiàn)表明,特異性微環(huán)境應(yīng)激可能引導(dǎo)T細(xì)胞的分化,并刺激T細(xì)胞的充分激活,從而通過迫使腫瘤特異性T細(xì)胞向干細(xì)胞樣T細(xì)胞分化,從而保持其抗腫瘤能力。
圖2. 微環(huán)境的挑戰(zhàn)偏轉(zhuǎn)T細(xì)胞分化和耗竭
耗竭型T細(xì)胞中的表觀遺傳學(xué)重組
雖然終末期耗竭型T細(xì)胞表達(dá)大量的PD-1,但由于固定的表觀遺傳學(xué)特征,PD-1阻斷治療只部分增加TCR信號,并不能引起持久的效應(yīng)功能;因此,PD-1阻斷治療可能無法完全重新激活終末耗竭型T細(xì)胞,或通過將耗竭型T細(xì)胞轉(zhuǎn)化為記憶T細(xì)胞提供持久的抗腫瘤反應(yīng)。有趣的是,CD8+ TILs的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)在T細(xì)胞耗竭的發(fā)展過程中逐漸改變。同樣,對慢性LCMV感染后耗竭的T細(xì)胞染色質(zhì)的易及性檢測表明,耗竭的T細(xì)胞顯示出與效應(yīng)T細(xì)胞和記憶T細(xì)胞不同的染色質(zhì)表型;這些發(fā)現(xiàn)表明:耗竭是一種特定的T細(xì)胞的命運(yùn),且與染色質(zhì)表型的明顯變化有關(guān)。
最近的研究表明,DNA結(jié)合蛋白TOX對T細(xì)胞耗竭的發(fā)展至關(guān)重要,并參與慢性病毒感染和腫瘤中的T細(xì)胞耗竭過程中發(fā)生的表觀遺傳重塑。研究表明,在急性LCMV感染期間,對病毒特異性CD8+ T細(xì)胞的TOX刪除并不能阻止效應(yīng)T細(xì)胞和記憶T細(xì)胞的形成;然而,在慢性LCMV感染和腫瘤的情況下,TOX缺陷確實與CD8+ T細(xì)胞更好的抗病毒和抗腫瘤活性,以及抑制受體的表達(dá)減少相關(guān)。但是,在慢性病毒感染和腫瘤發(fā)展過程中,TOX缺陷的CD8+ T細(xì)胞不能存活,這表明,在長期暴露于抗原的情況下,TOX介導(dǎo)的信號和表觀遺傳程序?qū)τ诰S持耗竭型T細(xì)胞的生存是必要的。除TOX外,核受體轉(zhuǎn)錄因子NR4a已被證明通過協(xié)調(diào)CD8+ TILs和嵌合抗原受體(CAR) T細(xì)胞中耗竭相關(guān)的表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化來驅(qū)動T細(xì)胞耗竭。在腫瘤特異性CD8+ T細(xì)胞和CAR - T細(xì)胞的過繼細(xì)胞轉(zhuǎn)輸中,NR4a的缺失提高了T細(xì)胞抗腫瘤活性。有趣的是,在CD8+ TILs中,TOX和NR4a之間的相互調(diào)節(jié)可能進(jìn)一步加強(qiáng)耗竭型T細(xì)胞的表型和表觀遺傳學(xué)。此外,由DNMT3A酶引起的DNA甲基化在染色質(zhì)易及性中起著關(guān)鍵作用,也被證明對T細(xì)胞耗竭有作用。總的來說,這些發(fā)現(xiàn)證明了表觀遺傳改變在協(xié)調(diào)T細(xì)胞衰竭中的重要性;然而是否其他細(xì)胞性的改變,特別是代謝不足和應(yīng)激反應(yīng),是導(dǎo)致T細(xì)胞耗竭的表觀遺傳重編程所必需的,尚需進(jìn)一步研究。
圖3. 耗竭型T細(xì)胞中的代謝改變與表觀遺傳學(xué)的交互作用
線粒體適應(yīng)性與耗竭型T細(xì)胞
TCR激活能引起線粒體動力學(xué)改變以適應(yīng)效應(yīng)T細(xì)胞的生物能需求,還導(dǎo)致ER中蛋白質(zhì)合成和鈣穿梭的顯著升高。為什么耗竭型T細(xì)胞會導(dǎo)致線粒體適應(yīng)性下降和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)持續(xù)壓力,以及這些缺陷是否會協(xié)調(diào)T細(xì)胞衰竭的表型和表觀遺傳程序,在很大程度上仍不清楚。
線粒體是調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝和活動的關(guān)鍵細(xì)胞器,已被證明在T細(xì)胞激活過程中被動態(tài)調(diào)節(jié)。來自慢性病毒感染和腫瘤的耗竭型T細(xì)胞表現(xiàn)出代謝不足,包括葡萄糖攝取和OXPHOS降低。此外,CD8+ TILs已被證明由于支持線粒體生物發(fā)生和抗氧化反應(yīng)中起關(guān)鍵作用的轉(zhuǎn)錄共激活體PGC1α的表達(dá)減少而失去線粒體活性和生物發(fā)生(biogenesis)的能力。在B16小鼠腫瘤模型中,腫瘤特異性CD8+ T細(xì)胞中過表達(dá)PGC1α可增加線粒體的生物發(fā)生(biogenesis)并維持效應(yīng)功能。同樣,來自慢性腎性LCMV感染小鼠的早期激活的LCMV特異性CD8+ T細(xì)胞含有去極化線粒體,阻礙T細(xì)胞的代謝適應(yīng)。在病毒感染背景下,在LCMV特異性CD8+ T細(xì)胞中過表達(dá)PGC1α可導(dǎo)致耗竭表型的降低,以及早期激活的LCMV特異性CD8+ T細(xì)胞中線粒體功能障礙的緩解和代謝適應(yīng)改善。除了PGC1α,最近一項使用CRISPR-Cas9突變篩選的體內(nèi)研究表明,通過靶向核糖核酸酶REGNASE-1, CD8+ T細(xì)胞增殖為長效效應(yīng)細(xì)胞,并改善了線粒體適應(yīng)度和抗腫瘤反應(yīng)。為了支持這些發(fā)現(xiàn),人類研究表明,HBV感染患者的CD8+ T細(xì)胞衰竭后,編碼線粒體蛋白和線粒體生物發(fā)生調(diào)節(jié)因子的基因表達(dá)也大幅下降,并含有更多的去極化線粒體。去極化線粒體的積累導(dǎo)致線粒體活性氧(mtROS)的大量產(chǎn)生,從而對T細(xì)胞效應(yīng)功能產(chǎn)生正反兩方面的影響。在同一項研究中,發(fā)現(xiàn)mtROS清除可有效恢復(fù)HBV特異性衰竭T細(xì)胞的效應(yīng)和抗病毒反應(yīng)。mtROS的衰減也使人腎細(xì)胞癌患者的CD8+ TILs恢復(fù)效應(yīng)功能,類似于HBV20患者T細(xì)胞耗竭的觀察結(jié)果。此外,我們最近發(fā)現(xiàn),去極化線粒體在CD8+ TILs中逐漸積累,TILs中大量去極化線粒體積累顯示出終末期耗竭型T細(xì)胞特征,包括效應(yīng)功能下降,表觀遺傳學(xué)改變和TCF-1表達(dá)下調(diào)。
腫瘤細(xì)胞線粒體是腫瘤代謝物2-羥戊二酸(2HG)的來源,主要通過變異的異檸檬酸脫氫酶IDH1和IDH2產(chǎn)生(R)-2HG。有趣的是,激活后T細(xì)胞可以在生理條件下產(chǎn)生對映體(S)-2HG,包括TCR觸發(fā)或缺氧。(S)-2HG具有通過調(diào)節(jié)組蛋白和DNA去甲基化而改變T細(xì)胞分化的潛力,它的產(chǎn)生已被證明是由乳酸脫氫酶A (LDHA)轉(zhuǎn)化谷氨酰胺衍生的α-酮戊二酸(α-KG)的結(jié)果。此外,T細(xì)胞攝?。≧)-2HG擾亂了多胺的生物合成和轉(zhuǎn)錄因子NFAT97的轉(zhuǎn)錄活性。盡管來自腫瘤或慢性感染的耗竭型T細(xì)胞的發(fā)育過程不同,耗竭型T細(xì)胞不僅共享一個核心分子程序,而且表現(xiàn)出類似的代謝表型,如糖酵解活性和OXPHOS降低,以及線粒體適應(yīng)性減弱。這些代謝表型可能是由腫瘤和慢性感染之間的不同環(huán)境信號觸發(fā)的。例如,在腫瘤中發(fā)現(xiàn)糖酵解活性下降,因為TME中葡萄糖(糖酵解的必要營養(yǎng)物質(zhì))被剝奪,從而限制了TILs的能量生產(chǎn)和效應(yīng)功能;在慢性感染中,強(qiáng)大的PD-1信號強(qiáng)烈抑制糖酵解,在病毒特異性衰竭T細(xì)胞中產(chǎn)生一種葡萄糖剝奪樣狀態(tài)。結(jié)合來自腫瘤和慢性病毒感染的T細(xì)胞中HIF信號的激活, T細(xì)胞可能經(jīng)歷不適當(dāng)?shù)拇x重編程,引發(fā)線粒體功能障礙,從而在兩種模型中提供了T細(xì)胞耗竭和代謝不良之間的科學(xué)聯(lián)系。這些發(fā)現(xiàn)表明了線粒體的質(zhì)量以及潛在的線粒體活動,在協(xié)調(diào)T細(xì)胞的功能和命運(yùn)的過程中的重要性。在此背景下,線粒體代謝的調(diào)節(jié)可能會在上促進(jìn)TILs應(yīng)對TME代謝應(yīng)激的能力,進(jìn)一步提高耗竭型T細(xì)胞的抗腫瘤活性。
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與T細(xì)胞耗竭
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)擁有復(fù)雜的機(jī)制,可以感知由錯誤折疊和折疊蛋白以及生理和病理刺激(如葡萄糖剝奪)引起的壓力。由于未折疊和錯誤折疊蛋白的積累,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激誘導(dǎo)后,伴侶蛋白BiP與激酶PERK1、應(yīng)激傳感器IRE1α和轉(zhuǎn)錄因子ATF6分離,并結(jié)合內(nèi)質(zhì)網(wǎng)未折疊蛋白。這種解離導(dǎo)致PERK1, IRE1α和ATF6的激活,包括PERK1和IRE1α的二聚和自磷酸化,以及ATF6的切割,從而觸發(fā)下游轉(zhuǎn)錄事件的生成調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子XBP1和CHOP。雖然已知這一系列的蛋白反應(yīng)可以調(diào)節(jié)T細(xì)胞的發(fā)育、穩(wěn)態(tài)、激活和功能,但內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激是否也會影響T細(xì)胞在慢性病毒感染或TME中遇到應(yīng)激時衰竭的形成,目前尚不清楚。研究表明,在急性LCMV感染期間,病毒特異性CD8+ T細(xì)胞中XBP1的丟失導(dǎo)致KLRG1hiCD127lo短壽命效應(yīng)細(xì)胞亞群的減少。出乎意料的是,最近的一項研究表明,TILs中葡萄糖攝取和蛋白糖基化的降低誘導(dǎo)IRE1α-XBP1信號軸,從而抑制小鼠和人類卵巢癌中T細(xì)胞線粒體活性和抗腫瘤免疫。除了糖酵解和蛋白糖基化損傷外,膽固醇超載在CD8+ TILs中是觸發(fā)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激和XBP1表達(dá)的另一機(jī)制,這反過來進(jìn)一步刺激B16腫瘤模型中抑制性受體的表達(dá),包括PD-1和自然殺傷細(xì)胞受體2B4。此外,在TILs中,PERK-CHOP信號軸升高;CHOP通過阻礙細(xì)胞因子INF-γ的生成直接抑制轉(zhuǎn)錄因子Tbx21的表達(dá),這是T細(xì)胞效應(yīng)功能的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。總的來說,異常的代謝程序和代謝不足誘導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,從而觸發(fā)T細(xì)胞耗竭的發(fā)生。然而,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激誘導(dǎo)的T細(xì)胞衰竭是否會導(dǎo)致表觀遺傳重組,從而促進(jìn)T細(xì)胞永久性功能障礙,以及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)是否會在慢性病毒感染期間驅(qū)動T細(xì)胞衰竭,目前尚不清楚。
圖4 線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)信號在耗竭型T細(xì)胞中的作用
免疫檢查點對線粒體動力學(xué)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)的影響
如前所述,ER相關(guān)和線粒體相關(guān)的細(xì)胞反應(yīng)與T細(xì)胞免疫和T細(xì)胞耗竭的發(fā)展密切相關(guān)。新的證據(jù)也表明,免疫檢查點參與觸發(fā)代謝程序、線粒體動力學(xué)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)的變化。例如,PD-1信號抑制糖酵解,但促進(jìn)脂肪酸在CD8+ T細(xì)胞中的利用;然而,PD-1信號通路也通過抑制線粒體適應(yīng)度來抑制CD8+ T細(xì)胞中的OXPHOS。此外,在慢性LCMV感染期間CD8+ T細(xì)胞中PD-1的丟失增加了LCMV特異性CD8+ T細(xì)胞的葡萄糖攝取并改善了線粒體功能障礙。此外,PD -1刺激的T細(xì)胞已經(jīng)被證明可以減少線粒體嵴的數(shù)量和長度,從而導(dǎo)致線粒體功能障礙。PD -1誘導(dǎo)的線粒體功能障礙可能是轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子Bhlhe40下調(diào)的結(jié)果,而Bhlhe40對于維持B16黑色素瘤模型中TILs的線粒體適應(yīng)度和活躍的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)至關(guān)重要。與PD-1信號通路在增加脂肪酸氧化中的作用相一致,PD-1阻斷劑與過氧化物酶體增殖劑激活受體的拮抗劑聯(lián)合使用,能夠改善MC38結(jié)腸癌模型的CD8+ TILs線粒體健康和氧化代謝,促進(jìn)腫瘤控制。與PD-1相對應(yīng)的,受體4-1BB(也在耗竭型T細(xì)胞上高表達(dá))增強(qiáng)了線粒體能力,改善了代謝充分性。在PD-1和4-1BB信號通路控制的代謝調(diào)節(jié)的基礎(chǔ)上,聯(lián)合PD-1阻斷和4-1BB靶向治療已被證明能在B16黑色素瘤模型中誘發(fā)強(qiáng)大的抗腫瘤T細(xì)胞免疫。然而,腫瘤環(huán)境中的有效營養(yǎng)和TILs的代謝重組編程是否是產(chǎn)生有效免疫檢查阻斷治療所必需的仍有探索。
“論腫道麻”述評
本文闡述了T細(xì)胞代謝在腫瘤和慢性感染中的變化,總結(jié)了目前關(guān)于T細(xì)胞耗竭發(fā)生機(jī)制的研究,探討了T細(xì)胞衰竭、代謝適應(yīng)性和表觀遺傳調(diào)控之間的關(guān)系,并強(qiáng)調(diào)了如何通過代謝調(diào)節(jié)使耗竭的T細(xì)胞恢復(fù)活力來獲得更好的抗腫瘤和抗病毒免疫能力。在免疫檢查點阻斷治療(ICB)中,PD-1的作用對一部分腫瘤患者來說確實表現(xiàn)出良好持久的腫瘤抑制作用,然而,仍有相當(dāng)一部分患者對治療沒有反應(yīng)或是最終復(fù)發(fā),這里面部分原因就在于終末期耗竭型T細(xì)胞的形成。因此,開發(fā)新的治療方法,提高療效,恢復(fù)耗竭型T細(xì)胞的抗腫瘤活性,增加耗竭型T細(xì)胞祖細(xì)胞的形成,是目前免疫治療的一個重要方向。綜上所述,直接重塑T細(xì)胞代謝程序,以及提高T細(xì)胞線粒體適應(yīng)性,均可以促進(jìn)耗竭型T細(xì)胞重獲效應(yīng)功能,增加細(xì)胞對PD-1阻斷治療的反應(yīng)性。此外,以影響T細(xì)胞表觀基因組的代謝程序為治療靶點等方法調(diào)節(jié)T細(xì)胞的表觀遺傳背景以降低抑制性受體的表達(dá),同時增加效應(yīng)分子產(chǎn)生的治療也將是無價之寶。
在慢性病毒感染和腫瘤發(fā)展過程中,失調(diào)的代謝程序和應(yīng)激反應(yīng)導(dǎo)致了T細(xì)胞免疫功能受損,成為了這些疾病免疫治療失效的重要原因。了解在T細(xì)胞衰竭的發(fā)展過程中,失調(diào)的代謝程序和應(yīng)激反應(yīng)協(xié)調(diào)信號和表觀遺傳改變的機(jī)制,將為了解T細(xì)胞分化中的免疫代謝調(diào)節(jié)開辟新的視野。了解這些未被探索的聯(lián)系有潛力揭示新的治療策略,以重新激活耗竭型T細(xì)胞和改善當(dāng)前ICB治療的臨床結(jié)果有著重要的意義。另外,控制T細(xì)胞耗竭的代謝調(diào)節(jié)通路可能與慢性病毒感染、營養(yǎng)過剩以及微生物產(chǎn)生的代謝物引起的全身代謝改變相互交織。因此,在未來幾年,隨著代謝調(diào)節(jié)和干預(yù)對T細(xì)胞免疫的影響,這方面的知識有望得到有力的擴(kuò)展,這必將為未來的免疫治療提供關(guān)鍵性的指導(dǎo)和方向。
編譯:周文昌;述評:翁梅琳 審校:張軍,繆長虹
參考文獻(xiàn): Franco Fabien,Jaccard Alison,Romero Pedro,Yu Yi Ru,Ho Ping Chih. Metabolic and epigenetic regulation of T-cell exhaustion[J]. Nature Metabolism,2020,2(10):
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網(wǎng)址: Nature Metabolism綜述:T細(xì)胞耗竭的代謝和表觀遺傳學(xué)調(diào)控 http://www.u1s5d6.cn/newsview236570.html
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