健康人胎盤(pán)的蛋白質(zhì)組學(xué)概況,Clinical Proteomics
健康人胎盤(pán)的蛋白質(zhì)組學(xué)概況
Clinical Proteomics ( IF 2.8 ) Pub Date : 2023-01-02 , DOI: 10.1186/s12014-022-09388-4
Samprikta Manna 1 , Julia Scheel 2 , Aisling Noone 3 , Colm J McElwain 4 , Caitriona Scaife 5 , Shailendra Gupta 2 , Jane English 3, 6 , Cathal McCarthy 4 , Fergus P McCarthy 1, 6
胎盤(pán)仍然是人體內(nèi)研究最少的器官之一。然而,胎盤(pán)功能障礙與導(dǎo)致孕產(chǎn)婦和胎兒死亡以及長(zhǎng)期健康后果的各種妊娠并發(fā)癥有關(guān)。本研究的目的是使用無(wú)標(biāo)記定量質(zhì)譜法表征健康足月胎盤(pán)亞解剖區(qū)域的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)。在五個(gè)取樣點(diǎn)對(duì)三個(gè)健康胎盤(pán)進(jìn)行取樣,并將每個(gè)活組織檢查分為母體、中間體和胎兒亞解剖區(qū)域。四極軌道阱質(zhì)譜儀用于數(shù)據(jù)依賴分析模式,以在區(qū)域之間進(jìn)行詳細(xì)的差異表達(dá)之前識(shí)別 1859 種獨(dú)特的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)譜分析分別在母體、中間和胎兒亞解剖區(qū)域鑒定了 1081、1086 和 1101 種蛋白質(zhì)。考慮到樣品位點(diǎn)位置和亞解剖區(qū)域?qū)Φ鞍踪|(zhì)表達(dá)的影響,鑒定了差異表達(dá)的蛋白質(zhì)。其中,在樣本點(diǎn)位置和亞解剖區(qū)域之間識(shí)別出 374 種差異表達(dá)的蛋白質(zhì)(雙向方差分析調(diào)整后的 p 值 < 0.05,HSD Tukey 調(diào)整后的 p 值 0.05)。胎盤(pán)特定疾病地圖 NaviCenta ( https://www.sbi.uni-rostock.de/minerva/index.xhtml?id=NaviCenta ) 用于將功能分析結(jié)果集中到胎盤(pán)特定上下文中。隨后,進(jìn)行了以衰老和線粒體功能為重點(diǎn)的功能分析。在蛋白質(zhì)強(qiáng)度和組成的亞解剖區(qū)域之間觀察到顯著差異。母體亞解剖區(qū)域內(nèi)抗衰老蛋白的減少,并且觀察到與從 ATP 轉(zhuǎn)換為脂肪酸消耗相關(guān)的蛋白質(zhì)增加,作為中間和胎兒亞解剖區(qū)域之間的能量來(lái)源。這些結(jié)果表明胎盤(pán)的解剖結(jié)構(gòu)中存在正常的蛋白質(zhì)組學(xué)變異,因此推薦連續(xù)切片方法用于一致的胎盤(pán)研究。
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更新日期:2023-01-02
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