哥倫比亞大學(xué)Harris H. Wang團(tuán)隊(duì)?在《Nature Microbiology》期刊上(IF=28.3)發(fā)表了關(guān)于409種細(xì)菌-藥物對(duì)揭示腸道微生物群擾動(dòng)的驅(qū)動(dòng)因素的文章，該研究通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)定結(jié)果進(jìn)行生信分析，強(qiáng)調(diào)了大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學(xué)在腸道微生物-外源化學(xué)物相互作用的功能發(fā)現(xiàn)方面的實(shí)用性。
期刊：Nature Microbiology
影響因子：28.3
發(fā)表時(shí)間：2024.02
樣本類型：細(xì)菌、人糞便
一、研究背景
許多藥物可以擾亂腸道微生物群，有可能導(dǎo)致負(fù)面的健康后果。然而，大多數(shù)微生物-藥物反應(yīng)的機(jī)制尚未在遺傳水平上闡明。本研究利用高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)，系統(tǒng)地描述了暴露于最常用的口服藥物的流行的人類腸道細(xì)菌的基因表達(dá)譜，為了解藥物介導(dǎo)的微生物群轉(zhuǎn)移的驅(qū)動(dòng)因素提供了一個(gè)資源，以便更好地了解臨床干預(yù)。
二、研究思路
圖 研究思路 注：BMIS：自身體質(zhì)量指數(shù)譜
三、研究結(jié)論
本研究通過(guò)高通量原核轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法，系統(tǒng)分析了常用口服藥物對(duì)常見(jiàn)人類腸菌基因表達(dá)的影響，涉及409個(gè)藥物-腸菌配對(duì)，為理解藥物介導(dǎo)的菌群改變提供了機(jī)制性見(jiàn)解和研究資源；他汀類藥物能上調(diào)擬桿菌目細(xì)菌的AcrAB-TolC外排泵，使這些菌對(duì)膳食成分（如維生素A）和次級(jí)膽汁酸的抗菌/毒性作用更敏感，服用辛伐他汀的患者中攜帶acrAB-tolC基因的腸菌減少，側(cè)面印證他汀類藥物引起的腸菌acrAB-tolC表達(dá)上調(diào)會(huì)影響細(xì)菌活性。
參考文獻(xiàn)
Ricaurte D, et al. High-throughput transcriptomics of 409 bacteria-drug pairs reveals drivers of gut microbiota perturbation. Nat Microbiol. 2024.返回搜狐，查看更多
責(zé)任編輯：
