解讀羊水穿刺基因檢測(cè)報(bào)告,科學(xué)認(rèn)知染色體拷貝數(shù)變異(CNV)
導(dǎo)讀: 遺傳學(xué)檢查通常分為分染色體水平和基因水平的檢測(cè)。再次強(qiáng)調(diào)臨床上絨毛取樣,羊水或臍血穿刺實(shí)際上都是指獲取胎兒樣本的手段而非檢測(cè)方法。獲取胎兒樣本后根據(jù)不同的臨床指征會(huì)選擇相應(yīng)的檢測(cè)手段,如染色體培養(yǎng)核型分析,染色體拷貝數(shù)檢測(cè),基因檢測(cè)等。 目前臨床上染色體層面最常用的檢測(cè)方法就是核型分析和染色體拷貝數(shù)(CNV)檢測(cè)。 本系列分為三個(gè)小文章,分別從染色體核型、染色體拷貝數(shù)變異及基因突變方面跟大家聊聊如
遺傳學(xué)檢查通常分為分染色體水平和基因水平的檢測(cè)。再次強(qiáng)調(diào)臨床上絨毛取樣,羊水或臍血穿刺實(shí)際上都是指獲取胎兒樣本的手段而非檢測(cè)方法。獲取胎兒樣本后根據(jù)不同的臨床指征會(huì)選擇相應(yīng)的檢測(cè)手段,如染色體培養(yǎng)核型分析,染色體拷貝數(shù)檢測(cè),基因檢測(cè)等。
目前臨床上染色體層面最常用的檢測(cè)方法就是核型分析和染色體拷貝數(shù)(CNV)檢測(cè)。
本系列分為三個(gè)小文章,分別從染色體核型、染色體拷貝數(shù)變異及基因突變方面跟大家聊聊如何合理的解讀羊水穿刺后的檢測(cè)結(jié)果,避免孕婦及家屬增加不必要的擔(dān)憂,但又不耽誤常規(guī)診療。
什么是染色體CNV檢測(cè)?
染色體CNV檢測(cè)亦可稱為“染色體微小缺失微小重復(fù)檢測(cè)”,舉個(gè)例子:“核型檢查”可理解為我們?cè)谶h(yuǎn)處看一個(gè)大樓,只能看到這個(gè)大樓的外觀及高矮胖瘦,而CNV檢測(cè)就相當(dāng)于我們用“華為P30 pro”來(lái)看這個(gè)大樓,這樣就能看到每個(gè)樓層的情況,如果還不理解的話見(jiàn)下圖,當(dāng)然第四張圖純是為了表示效果并不代表真實(shí)情況。
“核型檢測(cè)” 與 “CNV檢測(cè)”
“核型檢測(cè)”與“CNV檢測(cè)模式圖”
目前染色體CNV或者說(shuō)微缺失微重復(fù)檢測(cè)方法通常有兩種:一個(gè)通俗叫做“芯片”,一個(gè)通俗叫“測(cè)序”。實(shí)際上準(zhǔn)確的叫法一個(gè)是【染色體微陣列分析(chromosome microarray analysis, CMA),檢測(cè)基于芯片平臺(tái)】;一個(gè)是【低深度全基因組測(cè)序(copy number variation sequencing, CNV-seq),檢測(cè)基于高通量測(cè)序平臺(tái)】。這兩種方法的專家指南都已經(jīng)發(fā)表,但需要特別特別強(qiáng)調(diào)的是這兩個(gè)技術(shù)都是檢測(cè)染色體層面的,跟基因沒(méi)什么關(guān)系,千萬(wàn)不要以為做這兩個(gè)檢測(cè)就能把單基因病檢測(cè)出來(lái)。另外,大家不用特別糾結(jié)這兩種檢測(cè)方法的區(qū)別,對(duì)于臨床診斷來(lái)說(shuō)都足夠。
CNV檢測(cè)結(jié)果的解讀
再來(lái)說(shuō)說(shuō)染色體CNV檢測(cè)的結(jié)果,大致可以分三類:【完全正常或多態(tài)性】,【致病性片段】及【臨床意義未明】。值得一提的是,由于分子遺傳學(xué)檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展,比如染色體CNV檢測(cè),染色體層面的產(chǎn)前診斷的時(shí)間不再局限于細(xì)胞培養(yǎng)的最佳時(shí)間(18-26周),臍血穿刺也幾乎被羊水取代。下面我以幾個(gè)盛京醫(yī)院羊水報(bào)告來(lái)舉例,大概講講如何解讀這三個(gè)結(jié)果。
盛京醫(yī)院報(bào)告樣式
1.完全正?;蚨鄳B(tài)
完全正常或多態(tài):通??匆?jiàn)這兩種即代表并未檢出異常,可以認(rèn)為染色體是正常的。只要產(chǎn)檢時(shí)拿給醫(yī)生看下即可。
下面是兩份結(jié)果為含有致病片段的報(bào)告:
2.致病性片段
致病性片段:通常導(dǎo)致胎兒畸形或出生缺陷。如果報(bào)告上描述的畸形與胎兒超聲有相符合的癥狀,那就更加提高胎兒患病的風(fēng)險(xiǎn),這時(shí)應(yīng)立即找專業(yè)的產(chǎn)前診斷醫(yī)生進(jìn)行下一步處置。
3.臨床意義未明片段
這種情況是臨床上最常見(jiàn)的,出現(xiàn)這樣的結(jié)果通常應(yīng)為這樣的片段數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有記載,同時(shí)文獻(xiàn)中也無(wú)法查到其是否致病。由于技術(shù)的發(fā)展,我們每天都會(huì)檢測(cè)出來(lái)很多新的未知的變異,這些變異是否致病目前尚不清楚,缺乏大的數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì),但隨著數(shù)據(jù)積累的越來(lái)越多,我們對(duì)這些變異的功能都會(huì)搞清楚(這也是我工作的一個(gè)內(nèi)容)。對(duì)于這樣的片段的理解通常如下:
(1)如果缺失片段在1Mb以下,重復(fù)片段在1.5Mb以下,而且不包含基因,一般來(lái)說(shuō)應(yīng)該只是個(gè)正常變異,絕大部分都是遺傳自正常雙親,所以當(dāng)看到報(bào)告里寫著有0._Mb缺失重復(fù)的時(shí)候,千萬(wàn)別上火動(dòng)了胎氣,尤其是超聲未提示任何異常,這時(shí)請(qǐng)按照正常產(chǎn)檢的心情來(lái)咨詢并進(jìn)行下一步診治;
(2)當(dāng)缺失重復(fù)片段較大,且不包含任何基因,也無(wú)任何超聲異常時(shí),請(qǐng)不要著急上火,速來(lái)找專業(yè)醫(yī)生咨詢,我們見(jiàn)過(guò)正常人缺失7MB情況,沒(méi)有任何異常,胎兒也攜了這個(gè)缺失片段,生后亦無(wú)異常;
(3)無(wú)論缺失重復(fù)片段大小與否,如果包含相關(guān)基因,也請(qǐng)不要著急,速來(lái)找專業(yè)醫(yī)生咨詢并驗(yàn)證該判斷來(lái)源,如果該片段是從雙親遺傳下來(lái)的,通常也不會(huì)致病。
(4)對(duì)于臨床意義未明片段通常診斷最準(zhǔn)確的方法就是驗(yàn)證父母并結(jié)合超聲!
下面是一份結(jié)果為含有臨床意義不明的報(bào)告:
以上內(nèi)容只是臨床上比較常見(jiàn)的簡(jiǎn)單的情況的解讀和處理,主要還是為了降低孕婦及家屬的心理壓力做的科普。
醫(yī)學(xué)發(fā)展到今天也并未完全對(duì)神秘的人體研究透徹,真相有時(shí)令人大跌眼鏡。因此,千萬(wàn)不能根據(jù)以上內(nèi)容自己決定胎兒的去留,這是需要專業(yè)的醫(yī)生來(lái)判斷的。最后,無(wú)論任何情況下,如有不懂和疑問(wèn),請(qǐng)一定到正規(guī)的產(chǎn)前診斷中心找專業(yè)的醫(yī)生進(jìn)行遺傳咨詢。
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