30歲了! CELL重磅綜述:JAK
前言
Janus 激酶(JAK)-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子 (STAT) 通路的發(fā)現(xiàn)源于對(duì)細(xì)胞如何響應(yīng)干擾素(IFN)的研究,提供了一種細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的范例。
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院 (NIH)的John J. O’Shea及其團(tuán)隊(duì)是解析JAKs和STATs家族通路在免疫調(diào)節(jié)中作用的領(lǐng)先者,他們綜述的JAK-STAT通路研究文章于2022年10月發(fā)表在CELL期刊上,概述了JAK-STAT通路的主要里程碑式事件,并討論了目前的重大挑戰(zhàn)和未來機(jī)遇。
作者 | Ting
01背景介紹
Janus 激酶(JAK) 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子 (STAT) 通路的分子成分在30 年前被確定。圖1的簡(jiǎn)短歷史說明了這一發(fā)現(xiàn)使我們了解細(xì)胞外多肽驅(qū)動(dòng)生理和病理反應(yīng)的機(jī)制,包括細(xì)胞和生物體的發(fā)育、增殖、代謝、感染、炎癥和癌癥。
圖1 JAK-STAT 時(shí)間線(自 1984 年以來JAK-STAT通路的各種里程碑)
02信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的新范例
干擾素(IFN)于1957年被發(fā)現(xiàn),細(xì)胞如何響應(yīng)IFN產(chǎn)生抗病毒機(jī)制的問題引出了JAK-STAT通路的發(fā)現(xiàn)。
▲從IFN處理誘導(dǎo)的mRNA中產(chǎn)生cDNA文庫(kù)的能力允許發(fā)現(xiàn)幾個(gè)IFN誘導(dǎo)的基因,從而確定了控制IFN誘導(dǎo)基因表達(dá)的啟動(dòng)子和調(diào)控元件。
▲Stark和Kerr實(shí)驗(yàn)室使用IFN誘導(dǎo)基因的啟動(dòng)子,經(jīng)過誘變,分離出抗性細(xì)胞克隆,通過遺傳互補(bǔ),產(chǎn)生TYK2作為誘變劑滅活的必需基因。
▲使用相對(duì)較新的簡(jiǎn)并聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)方法生成蛋白激酶文庫(kù),鑒定了新的 TYK 家族,包括TYK2、JAK1 和 JAK2。JAK這個(gè)名字起源于兩面羅馬神Janus,因?yàn)樵摷っ讣易寰哂刑卣餍缘?strong>雙面結(jié)構(gòu)。
▲Darnell實(shí)驗(yàn)室純化出STAT(STAT1和STAT2,干擾素調(diào)節(jié)因子9(IRF9),其命名表示它們的雙重性功能,并強(qiáng)調(diào)它們的功能執(zhí)行速度快速。
03全長(zhǎng)JAK1結(jié)構(gòu)
隨著人類和其他基因組的完成,根據(jù)結(jié)構(gòu)確定JAK家族只有4個(gè)成員。JAK末端是一個(gè)羧基末端的催化或激酶結(jié)構(gòu)域,前端是一個(gè)假激酶 (PK) 或激酶樣結(jié)構(gòu)域。JAK通過氨基末端ezrin radixin、moesin (FERM)結(jié)構(gòu)域和Src Homology 2 (SH2)結(jié)構(gòu)域與細(xì)胞因子受體的Box1和Box2結(jié)構(gòu)域結(jié)合。直到最近才獲得與細(xì)胞因子受體的細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域復(fù)合的全長(zhǎng)JAK1結(jié)構(gòu)(圖2)。
圖2 Janus激酶的結(jié)構(gòu)
STAT3被鑒定為響應(yīng)IL-6的DNA結(jié)合“急性期反應(yīng)因子”。表皮生長(zhǎng)因子和其他生長(zhǎng)因子也被認(rèn)為是STAT3激活劑。STAT4主要在淋巴組織中表達(dá)并被IL-12、IL-23和I型干擾素激活。由催乳素激活的“乳腺特異性核因子”被鑒定并命名為STAT5,可被IL-2、IL-3、粒細(xì)胞巨噬細(xì)胞集落刺激因子(GM-CSF)和IL-5等因子激活。STAT6被鑒定并克隆為IL-4誘導(dǎo)因子。
04JAK-STAT通路信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
JAK-STAT通路信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo):細(xì)胞因子受體結(jié)合JAK,導(dǎo)致JAK在受體尾部的酪氨酸殘基的激活和磷酸化。受體磷酸化為細(xì)胞質(zhì)STAT創(chuàng)建對(duì)接位點(diǎn),STAT通過酪氨酸磷酸結(jié)合SH2結(jié)構(gòu)域被招募到受體復(fù)合物中,并自身磷酸化?;罨牧姿峄疭TAT(pSTAT)通過分子間SH2-磷酸酪氨酸相互作用形成同源或異源二聚化,易位到細(xì)胞核,結(jié)合DNA調(diào)控元件,改變?nèi)旧|(zhì)可及性,誘導(dǎo)基因轉(zhuǎn)錄(圖3)。
圖3 JAK-STAT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
05細(xì)胞因子信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控
● 生理性負(fù)調(diào)控
STAT靶基因的細(xì)胞因子信號(hào)抑制因子(SOCS家族)的SOCS蛋白通過與細(xì)胞因子受體結(jié)合,與STATs競(jìng)爭(zhēng),干擾細(xì)胞因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。SOCS1和SOCS3的激酶抑制區(qū)(KIR)直接與JAK(JAK2、JAK1和TYK2)相互作用。其他關(guān)鍵的負(fù)反饋調(diào)節(jié)因子有泛素特異性肽酶18(USP18)和IFN刺激的基因15(ISG15)。激活STAT蛋白抑制劑(PIAS)家族由多個(gè)成員組成,它們作用于STATs和包括NF-kB在內(nèi)的其他因子,并通過多種機(jī)制干擾信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。
● 病毒相關(guān)的負(fù)調(diào)控
直接或間接靶向STAT的病毒抗免疫策略突出了STAT介導(dǎo)的IFN信號(hào)通路作為抗病毒防御的重要性。STAT導(dǎo)向的IFN拮抗機(jī)制包括靶向STAT降解、隔離和細(xì)胞質(zhì)滯留。黃病毒,包括登革熱病毒和寨卡病毒,以STAT2為目標(biāo)進(jìn)行蛋白酶體依賴性降解。SARS-CoV-2 ORF6蛋白通過Nup98-Rae1核孔亞復(fù)合物干擾STAT的輸入。SARS-CoV-2 N蛋白也可介導(dǎo)STAT胞質(zhì)滯留。
06STAT結(jié)構(gòu)、復(fù)合物形成及對(duì)功能的影響
● 所有的STAT都具有相似的N端、卷曲螺旋、DNA結(jié)合、接頭、SH2和反轉(zhuǎn)錄激活域(ADs)(圖4)?;罨腏AK磷酸化一個(gè)STAT單體的保守酪氨酸殘基,然后與另一個(gè)單體的SH2結(jié)構(gòu)域結(jié)合,驅(qū)動(dòng)構(gòu)象變化,使STAT能夠易位到細(xì)胞核中,啟動(dòng)靶基因的轉(zhuǎn)錄。使用P-STAT來表示“典型的”酪氨酸磷酸化,U-STAT來表示沒有酪氨酸磷酸化的STAT。
圖4 STAT 結(jié)構(gòu)域和結(jié)構(gòu)
● STAT可以形成多種異源或同源二聚體。
STAT1、STAT3和STAT5a已被證明以平行或反平行的構(gòu)象形成同源二聚體(圖4;以STAT1為例)。STAT四聚體通過N端之間的相互作用協(xié)同招募同源二聚體成對(duì)形成。
響應(yīng)IFN I和III的基因表達(dá)由STAT1:STAT2異源二聚體驅(qū)動(dòng),并與IRF9一起組成干擾素刺激基因因子3(ISGF3)(圖5)。
● U-STAT1:U-STAT2二聚體不僅抑制多種P-STAT1同型二聚體的功能,還抑制ISGF3的形成。復(fù)合物形成也影響STAT的核質(zhì)穿梭。
圖5 STAT1和STAT2復(fù)合物的構(gòu)象變化
07STAT和轉(zhuǎn)錄調(diào)控
STAT復(fù)合物到達(dá)細(xì)胞核后就會(huì)完成與轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的任務(wù):參與染色質(zhì)化的靶基因、結(jié)合反應(yīng)元件,以及招募和激活RNA聚合酶II的轉(zhuǎn)錄共激活因子的募集。
●ISG的STAT調(diào)節(jié)
考慮到對(duì)病毒感染的快速反應(yīng)的必要性,ISG轉(zhuǎn)錄的誘導(dǎo)通常是快速的。這與轉(zhuǎn)錄速率的增加、快速mRNA加工和降解速率,并且沒有轉(zhuǎn)錄后控制相對(duì)應(yīng)。RNA Pol II重新招募到ISG是由IFN刺激的,ISGF3結(jié)合位點(diǎn)或附近的啟動(dòng)子和基因體的染色質(zhì)可及性增加,并招募SWI/SNF核小體重塑復(fù)合體亞基。組蛋白乙?;腿ヒ阴;?/strong>都是ISG轉(zhuǎn)錄激活所必需的。
●STAT和其他轉(zhuǎn)錄因子
在生理?xiàng)l件下,細(xì)胞接收多個(gè)并發(fā)信號(hào),激活多個(gè)信號(hào)通路。STAT和其他TF之間的相互作用包括TF合成的調(diào)控、TF活性的調(diào)節(jié)以及基因組內(nèi)影響轉(zhuǎn)錄的直接或間接相互作用。
●STAT之間的協(xié)同作用和拮抗作用
無論信號(hào)異同,不同的STAT都可以相互協(xié)同或拮抗,從而影響轉(zhuǎn)錄。由于 STAT1和STAT3的絲氨酸磷酸化,IL-2和IL-12介導(dǎo)的協(xié)同作用,導(dǎo)致更高水平的IFN-γ 表達(dá)。STAT之間的拮抗通常在IFN和STAT3激活細(xì)胞因子的狀態(tài)下,這一過程影響多種疾病的發(fā)生發(fā)展。
08細(xì)胞因子作用的基因組學(xué)視圖
STAT調(diào)節(jié)的增強(qiáng)子
STAT與基因組的結(jié)合有多種影響。干擾素疾病與IFN表觀基因組特征相關(guān),因此STAT可以介導(dǎo)誘導(dǎo)和抑制表觀基因組和轉(zhuǎn)錄組效應(yīng)。活性增強(qiáng)劑可對(duì)STAT產(chǎn)生廣泛影響(圖6),它們可以影響近端組蛋白修飾,也可以參與潛在增強(qiáng)子的形成,還可以驅(qū)動(dòng)缺乏LDTF結(jié)合基序區(qū)域的可及性。控制細(xì)胞類型特異性功能的關(guān)鍵基因往往受到被TFs、共激活因子、RNA Pol II和延伸因子密集占據(jù)的增強(qiáng)子簇的調(diào)控。
●STAT可以通過多種機(jī)制來傳遞其作用:直接轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)/抑制、表觀遺傳調(diào)節(jié)或兩者兼有,激活的STAT對(duì)表觀遺傳的調(diào)節(jié)有重要作用。
圖6 STAT和染色質(zhì)組織
09STAT的線粒體定位
除了在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中發(fā)揮突出作用外,還有一小部分STAT1、STAT3和STAT5(占總數(shù)的5%-10%)位于線粒體中。線粒體STAT3研究最多,可通過調(diào)節(jié)呼吸、氧化還原穩(wěn)態(tài)和線粒體轉(zhuǎn)錄直接促進(jìn)Ras誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)化。
10JAKs和STATs的體內(nèi)功能
●JAK突變
1、JAK的關(guān)鍵作用首次在嚴(yán)重聯(lián)合免疫缺陷(SCID)的人類中被證明。JAK3 常染色體隱性功能喪失(LOF)突變是導(dǎo)致SCID的重要原因。
2、人類TYK2缺乏與細(xì)菌和病毒感染以及過敏性疾病有關(guān)。人類TYK2的LOF變異(P1104A)與自身免疫性疾病的發(fā)病率的降低和結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)的增加相關(guān)。
3、JAK2對(duì)包括造血生長(zhǎng)因子在內(nèi)的多種細(xì)胞因子具有重要作用。在骨髓增生性腫瘤(MPNs)患者中發(fā)現(xiàn)了JAK2 GOF突變。
4、人類的JAK1 LOF突變與復(fù)發(fā)性分枝桿菌感染、發(fā)育遲緩和早期轉(zhuǎn)移性膀胱癌相關(guān)。JAK1 GOF突變導(dǎo)致自身炎癥相關(guān)疾病和高免疫球蛋白E綜合征(HIES)。
●STAT突變
1、STAT1-GOF患者易患自身免疫性疾病,對(duì)真菌和病毒感染的易感性增加;
小鼠和人類的STAT2 LOF突變導(dǎo)致了對(duì)病毒的易感性增加。
2、STAT3的LOF突變是高免疫球蛋白 E(喬布氏)綜合征的分子基礎(chǔ)。STAT3 GWAS變異與炎癥性腸病 (IBD)、MS、2型糖尿病 (T2DM) 和心肌梗塞有關(guān),具有STAT3 GOF突變的患者好發(fā)淋巴造血系統(tǒng)腫瘤和多發(fā)性自身免疫性疾病。
3、人類的STAT4 LOF突變與真菌感染和病毒感染的易感性相關(guān)。STAT4變異與狼瘡、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)和干燥綜合征相關(guān)。
4、人類的STAT5B LOF突變會(huì)導(dǎo)致面部畸形和自身免疫。而且還可導(dǎo)致非克隆性高嗜酸性粒細(xì)胞增多、濕疹、蕁麻疹和腹瀉。
5、STAT6 GOF突變與伴有嗜酸性粒細(xì)胞增多癥的過敏性疾病相關(guān),包括過敏、哮喘和嗜酸性粒細(xì)胞增多癥。
● 負(fù)反饋調(diào)節(jié)器的突變
小鼠SOCS1缺乏對(duì)IFN-γ過敏是致命的,而SOCS1缺陷的人類表現(xiàn)出早發(fā)性自身免疫性和過敏性疾病。人類USP18和ISG15缺乏的主要后果是嚴(yán)重的系統(tǒng)性干擾素病。
表1 JAK-STAT 通路體內(nèi)功能
11癌細(xì)胞中JAK和STAT的復(fù)雜角色
Tel-JAK2融合蛋白和隨后鑒定的其他JAK2融合蛋白(如PCM1、SEC1A和PAX5)都與白血病相關(guān)。此外,STAT3的SH2結(jié)構(gòu)域二聚化、與DNA結(jié)合,轉(zhuǎn)錄激活,導(dǎo)致細(xì)胞癌變。
腫瘤與GOF突變有關(guān)。所有JAK和STAT的突變都很常見,但主要見于造血/淋巴系統(tǒng)惡性腫瘤中。包括乳腺癌、肺癌和結(jié)腸癌的非造血系統(tǒng)腫瘤中,JAK和STAT的突變發(fā)生較少,但并不意味著該通路與實(shí)體腫瘤無關(guān)。
在腫瘤微環(huán)境和間質(zhì)癌相關(guān)成纖維細(xì)胞中,STAT3可以通過改變細(xì)胞外基質(zhì)的產(chǎn)生、血管生成和代謝環(huán)境來驅(qū)動(dòng)腫瘤的發(fā)展和進(jìn)展。
12JAK/STAT通路的治療靶向性
●JAK抑制劑
目前11種JAK抑制劑已被批準(zhǔn)用于治療包括RA、銀屑病和特應(yīng)性皮炎等自身免疫系統(tǒng)疾病,移植物抗宿主病,骨髓纖維化,腫瘤,斑禿等各類疾病(表2)。小編之前也整理了截止到今年10月份的藥物信息,詳見推文:能取代修美樂成為未來藥王嗎?神奇JAK抑制劑最新匯總
到目前為止,JAK抑制劑的大多數(shù)不良事件都可以用已知的特定細(xì)胞因子對(duì)感染、貧血和癌癥的作用機(jī)制來解釋,其安全性在很大程度上可以與生物制劑相媲美。其他的不良相互作用包括血栓栓塞事件的風(fēng)險(xiǎn)增加,脂質(zhì)的改變,和心血管并發(fā)癥。
選擇性JAK抑制劑的開發(fā)干擾較少細(xì)胞因子的功能,能夠增加特異性,減少不良反應(yīng)。
靶向蛋白降解現(xiàn)在也是生成包括JAK1在內(nèi)的激酶抑制劑的一種選擇。
表2 獲批的 JAK 抑制劑
●STAT抑制劑
各種策略已被用于開發(fā)STAT抑制劑,包括干擾SH2介導(dǎo)的二聚體、DNA結(jié)合、或反轉(zhuǎn)錄激活和誘導(dǎo)STAT降解。多種抑制劑正在臨床試驗(yàn)中,目前進(jìn)展最快的藥物處于臨床II期,包括IONIS公司的靶向STAT3反義寡核苷酸Danvatirsen(國(guó)內(nèi)開展,三陰性乳腺癌),Hanlim公司的STAT抑制劑HL-237(韓國(guó)開展,類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎),Otsuka公司的STAT抑制劑OPB-111077(新加坡開展,實(shí)體瘤)。
●SOCS模擬物
SOCS擬肽藥物已在免疫和腫瘤臨床前模型中顯示出療效。
13未來的挑戰(zhàn)和機(jī)遇
●結(jié)構(gòu)和細(xì)胞生物學(xué)
關(guān)于細(xì)胞因子受體和STAT復(fù)合物的結(jié)構(gòu)信息仍然缺乏。隨著成像方式的進(jìn)步,可以使用更復(fù)雜的工具來分析細(xì)胞因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的早期事件。
●更全面地理解STAT介導(dǎo)的染色質(zhì)修飾和轉(zhuǎn)錄調(diào)控
盡管STAT是信號(hào)依賴性TF,但非磷酸化STAT1的作用說明了仍需探究U-STAT1如何修飾染色質(zhì)和三維基因組。
利用體細(xì)胞GOF STAT突變,詳細(xì)了解STAT對(duì)相分離的生物物理方面的結(jié)構(gòu)和功能貢獻(xiàn)將對(duì)解釋增強(qiáng)子在染色質(zhì)環(huán)之外的功能,以及增強(qiáng)子和啟動(dòng)子接近很重要。
●實(shí)現(xiàn)細(xì)胞、組織和刺激特異性程序
也許最大的挑戰(zhàn)是理解細(xì)胞如何使用有限的JAK和STAT傳遞由大量細(xì)胞因子產(chǎn)生的信號(hào)。
JAK-STAT通路可能有許多屬性幫助解決這一生物學(xué)難題。
首先是信號(hào)成分表達(dá)的特異性和調(diào)控。
第二,不同STAT激活幅度、磷酸化和去磷酸化速率、核易位和DNA結(jié)合不同。STAT異源二聚體的形成被認(rèn)為是特異性的一種因素。但在沒有同源DNA結(jié)合基序的情況下,STAT如何被招募仍有待闡明。
第三,許多刺激特異性STAT翻譯后修飾狀態(tài)影響細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸、DNA結(jié)合和轉(zhuǎn)錄潛力,但這些修飾通常不能全面和動(dòng)態(tài)地測(cè)量。但幾乎沒有關(guān)于JAK對(duì)不同刺激的翻譯后修飾的信息,這需要進(jìn)一步研究。
最后,多組學(xué)工具的產(chǎn)生便于全面測(cè)量隨著時(shí)間變化,在體內(nèi)單細(xì)胞響應(yīng)生理和相關(guān)病理的變化。
對(duì)JAK和STAT的更復(fù)雜的知識(shí)無疑將為具有更大特異性的新藥提供許多機(jī)會(huì)。
參考文獻(xiàn): 1.Philips RL, Wang Y, Cheon H, Kanno Y, Gadina M, Sartorelli V, Horvath CM, Darnell JE Jr, Stark GR, O'Shea JJ. The JAK-STAT pathway at 30: Much learned, much more to do. Cell. 2022 Oct 13;185(21):3857-3876. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.023. 2. 智慧芽
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